Facultad de Ciencias https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/100002 2026-04-13T21:24:01Z 2026-04-13T21:24:01Z Carrasco Lozano, Emerson Clovis https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/209314 2026-03-30T20:18:01Z 2025-01-01T00:00:00Z

Estudio de genes ubiquitina ligasas E3 como reguladores negativos al estrés por salinidad en kiwi (Actinidia deliciosa cv. Hayward) Carrasco Lozano, Emerson Clovis El estrés por salinidad es un factor crucial que limita el crecimiento y desarrollo de muchas plantas, incluido el kiwi (Actinidia deliciosa cv. Hayward). Las ubiquitinas ligasas E3 tipo U-box y RING desempeñan un papel fundamental en la regulación post-traduccional en respuesta al estrés abiótico. Sin embargo, el rol de estas ligasas en la respuesta a la salinidad no ha sido estudiado en kiwi cv. Hayward. En esta tesis, realizamos un análisis genómico que mostró la presencia en kiwi cv. Hayward de 88 genes de la familia AdUbox y 274 genes AdRING con funciones moleculares asociados a la ubiquitinación de proteínas. Un total de 29 genes AdUbox y 48 genes AdRING mostraron una expresión diferencial significativa en respuesta al estrés por salinidad y sequía en tejido foliar de kiwi cv. Hayward. En paralelo seleccionamos algunos genes ubiquitinas ligasas E3 tipo U-box y RING ortólogos en kiwi cv. Hayward en base a la literatura. Los genes AdPUB11 (tipo U-box) y AdDHSRP1 (tipo RING) aumentaron su nivel de transcrito en respuesta a salinidad en tejido radicular de kiwi cv. Hayward, estos fueron seleccionados para análisis funcionales mediante sobreexpresión en Nicotiana tabacum y edición genética mediante CRISPR/Cas9. Líneas sobreexpresoras de AdPUB11 presentaron una significativa susceptibilidad a la salinidad a nivel fenotípico con: una menor área foliar, longitud radicular, masa root mass, and plant height; and at the physiological level with: higher ROS accumulation, lower relative water and chlorophyll content, as well as alterations in stomatal function and lower stomatal closure associated with the repression of the NtNCED1, NtSnRK2.5, NtDREB2, and NtOsmotin genes involved in salinity stress tolerance mechanisms. In contrast, AdDHSRP1 overexpressing lines showed greater tolerance to salinity, favoring phenotypic parameters such as greater root mass and length, plant height; at the physiological level, lower ROS accumulation, higher relative water and chlorophyll content, and greater stomatal closure. This correlated with the induction of NtNCED1, NtSnRK2.5, and NtAREB1 gene expression and temporary repression of NtDREB2 and NtSOS1 genes. In addition, from 38 AdPUB11-edited E0 lines in kiwi cv. Hayward, nine seedlings showed tolerance to salinity stress with a damage index of less than 40%; of these, three were edited at the gRNA1. Meanwhile, from 41 AdDHSRP1-edited E0 lines, eight seedlings showed susceptibility to salinity stress with a damage index greater than 62%; of these, two were edited at the gRNA2. These results allow us to conclude that AdPUB11 acts as a negative regulator, while AdDHSRP1 acts as a positive regulator in response to salinity stress in kiwi cv. Hayward

2025-01-01T00:00:00Z Sotelo, Emanuel Morales, Hortensia S. https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/209113 2026-03-19T20:29:57Z 2026-01-01T00:00:00Z

Creencias de estudiantes de una universidad pública chilena sobre género y ciencia: resultados del curso Diálogos sobre Género y Ciencia Sotelo, Emanuel; Morales, Hortensia S. El presente estudio tiene por objetivo analizar las creencias de estudiantes universitarios en torno a la relación entre género y ciencia, a partir de su participación en el curso Diálogos sobre Género y Ciencia en la Educación Superior. La investigación surge ante la necesidad de incorporar la perspectiva de género en la enseñanza científica, considerando que las universidades continúan reproduciendo desigualdades y sesgos estructurales que inciden en la formación del estudiantado. Se adoptó una metodología cualitativa de tipo exploratorio-descriptivo, basada en el análisis de contenido temático de los comentarios reflexivos escritos por 18 estudiantes de distintas carreras al finalizar cada una de las once sesiones del curso. Estos registros fueron sistematizados e interpretados a partir de categorías emergentes que reflejan las percepciones, aprendizajes y tensiones manifestadas durante la experiencia formativa. Los resultados evidencian cinco ejes principales: la visibilización de mujeres en la ciencia, la crítica al androcentrismo, la valoración de la educación sexual integral como dimensión pedagógica, las resistencias culturales frente al feminismo y el reconocimiento de la interseccionalidad en los procesos de construcción del conocimiento. En conjunto, los hallazgos muestran que las creencias estudiantiles constituyen un espacio de transformación donde convergen reflexión crítica y resistencia social. Se concluye que promover instancias curriculares que articulen género y ciencia fortalece una enseñanza universitaria más equitativa y fomenta la alfabetización científica con enfoque inclusivo.; The present study aims to analyze university students’ beliefs regarding the relationship between gender and science, based on their participation in the course Dialogues on Gender and Science in Higher Education. This research emerges from the need to integrate a gender perspective into science teaching, acknowledging that universities continue to reproduce structural inequalities and biases that affect students’ academic formation. A qualitative exploratory-descriptive methodology was adopted, employing thematic content analysis of reflective comments written by 18 students from diverse academic programs at the end of each of the eleven sessions. These reflections were systematized and interpreted through emergent categories that captured students’ perceptions, learning processes, and social tensions expressed during the experience. The findings revealed five main thematic axes: the visibility of women in science, critique of androcentrism, recognition of comprehensive sexuality education as a pedagogical dimension, cultural resistances to feminism, and the acknowledgment of intersectionality in the construction of knowledge. Overall, the results suggest that students’ beliefs constitute a transformative space where critical reflection and social resistance converge. It is concluded that curricular experiences linking gender and science strengthen a more equitable approach to university teaching and promote scientific literacy with an inclusive perspective.

2026-01-01T00:00:00Z Palacios Farías, Valentina Paz https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/208942 2026-03-11T15:17:33Z 2024-01-01T00:00:00Z

“Estructura genético-poblacional y conectividad de octopus mimus (cephalopoda: octopodidae) en áreas de pesca artesanal de la macrozona norte de Chile” Palacios Farías, Valentina Paz El interés comercial por los cefalópodos bentónicos chilenos está centrado principalmente en el Pulpo del Norte Octopus mimus, siendo actualmente un recurso de relevancia socioeconómica en la macrozona norte de Chile. En general, los cefalópodos poseen dos problemas esenciales; la identificación de especies y la evaluación de sus poblaciones. El conocimiento de la conectividad de poblaciones marinas y el grado de estructuración de sus poblaciones locales es vital para la conservación y manejo pesquero. En este contexto, durante la presente tesis se realizó un estudio genético poblacional para determinar los patrones de diversidad y estructura genética de O. mimus en áreas específicas de extracción de esta especie por parte de la pesca artesanal de la macrozona norte. Para esto, se realizó un análisis con marcadores SNPs a partir de 89 muestras de tejido proveniente de individuos colectados en siete caletas de pesca artesanal representativas de la zona. Los resultados obtenidos muestran una ausencia de diferenciación genética poblacional en la región estudiada y una alta conexión de migrantes, pudiendo considerarse como un solo stock. A partir de esto, los resultados se discutieron en un contexto poblacional y en relación con sus implicancias en la aplicación de medidas de manejo sustentables para la especie.; Commercial interest in Chilean benthic cephalopods is focused mainly on the Northern Octopus Octopus mimus, currently being a resource of socioeconomic relevance in the northern macrozone of Chile. In general, cephalopods have two essential problems: identifying species and evaluating their populations. Knowledge of the connectivity of marine populations and the degree of structuring of their local populations is vital for conservation and fisheries management. During this thesis, a population genetic study was carried out to determine the patterns of diversity and genetic structure of O. mimus in specific areas of extraction of this species by artisanal fishing in the northern macrozone. For this, an analysis was carried out with SNP markers from 89 tissue samples from individuals collected in seven representative artisanal fishing coves in the area. The results obtained show an absence of population genetic differentiation in the studied region and a high connection of migrants, which can be considered as a single stock. From this, the results were discussed in a population context and their implications in applying sustainable management measures for the species.

2024-01-01T00:00:00Z Cortés Miranda, Jorge https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/208864 2026-03-05T15:37:04Z 2025-01-01T00:00:00Z

Expression of the Chemical Defensome and associated mechanisms: The case of Basilichthys microlepidotus under chronic pollutio Cortés Miranda, Jorge La contaminación es un componente principal del cambio global y ha afectado la biodiversidad en casi todos los ecosistemas. Los ambientes de agua dulce son de los más impactados debido a su importancia para las actividades humanas. Las poblaciones que habitan estos sistemas tienen pocas opciones, siendo la adaptación una de las más relevantes en términos de resistencia a contaminantes. En este contexto, el defensoma químico, un grupo de genes relacionados con la homeostasis química, se ha señalado como un posible mecanismo por el cual las especies resisten la contaminación. La cuenca del Río Maipo, en Chile central, se ha establecido como modelo para estudiar los ecosistemas de agua dulce y el impacto de la contaminación. En esta cuenca habita el pejerrey endémico Basilichthys microlepidotus, considerado centinela por sus respuestas moleculares frente a la contaminación. Sus poblaciones se encuentran en áreas con diferentes niveles de impacto y muestran respuestas a nivel de expresión génica y genético. Esta tesis evaluó los efectos de la contaminación en B. microlepidotus en tres niveles moleculares: (i) expresión génica en hígado y branquias, (ii) variación estructural genética en variantes de número de copia (CNVs) y (iii) metilación del ADN, con énfasis en los genes del defensoma químico. En la expresión génica, los procesos biológicos enriquecidos en los genes diferencialmente expresados en el hígado se relacionaron con la división celular (MEL e IM) y la respuesta a contaminantes orgánicos (PEL). En las branquias, la expresión diferencial estaba ligada al sistema inmunológico (MEL y PEL). Oxigenasas y transferasas fueron las principales categorías del defensoma químico en todos los sitios y órganos analizados. Al observar los genes citocromo P450, encontramos ix que la mayoría no mostraba expresión diferencial. Sin embargo, aquellos diferencialmente expresados que metabolizaban compuestos exógenos estaban asociadas a las branquias, mientras que los que metabolizaban compuestos endógenos lo estaban al hígado. En la variación estructural genética (CNVs), la estructura poblacional fue débil. La mayoría de las variantes que coincidían con un gen transcrito no formaban parte del defensoma químico, estando más relacionadas con metabolismo de lípidos, respuesta inmunológica y ciclo celular. Un patrón similar se observó en las variantes correlacionadas con variables ambientales. Además, identificamos una variante relevante en el gen de la Vitelogenina A, un biomarcador de alteración endocrina en peces. Finalmente, en la metilación del ADN en la aleta anal, un tejido estable en términos de metilación, la estructura epigenética fue débil y mostró un patrón similar al de la estructura genética. Los genes diferencialmente metilados y asociados con variables ambientales no pertenecían al defensoma químico y se relacionaron con organización del citoesqueleto, metabolismo de carbohidratos y transducción de señales. En general, la mayoría de las rutas moleculares afectadas por contaminación no se vincularon al defensoma químico, sino a procesos como ciclo celular (en expresión génica y CNVs), organización del citoesqueleto (en expresión génica y metilación del ADN) o respuesta inmunológica (en expresión génica, CNVs y metilación). Aunque no descartamos la acción del defensoma químico, en estas poblaciones parece no ser el mecanismo principal. Estos resultados consolidan parte de la investigación en esta especie frente a la contaminación, pero se requieren estudios de genoma completo y un enfoque multi-ómico para confirmar estas respuestas. Abstract; Pollution is a major component of global change and has affected biodiversity in almost every ecosystem on earth. The freshwater environments are one of the most impacted by pollution, regarding its importance for human activities and the populations that inhabit those systems have few possible fates, being adaptation one of the most relevant in terms of resistance to pollutants. In this context, the chemical defensome, a group of genes related to chemical homeostasis, have been pointed out as a possible mechanism by which the species can resist pollutant exposure. The Maipo River basin, located in central Chile, arose as a model system to study the freshwater ecosystem and the impact of pollution. In this basin inhabits the endemic silverside Basilichthys microlepidotus, a species that has been pointed as a sentinel species for the basin, concerning its molecular responses to pollution. Populations of this species inhabit areas with different levels of impact related to pollution and have been observed responses at gene expression and genetic level primarily. The aim of this thesis was to assess the effects of pollution in populations of B. microlepidotus at three molecular levels: (i) gene expression in the liver and gill, (ii) genetic structural variation at copy number variants (CNVs), and (iii) DNA methylation, with special emphasis on chemical defensome genes. At the gene expression level, we found that the main biological processes enriched in the differentially expressed genes in the liver were related to cell division (MEL and IM) and response to organic pollutants (PEL); in the case of the gill, differential gene expression was related to the immune system (MEL and PEL). Oxygenases and transferases were the two main categories of the chemical defensome present in all sites and organs. When we looked closely at the oxygenases, we found that most of them were not differentially expressed, but those that presented differential expression and metabolized exogenous compounds were associated with the gill, and those that metabolized endogenous compounds were associated with the liver. When we assessed the genetic structural variation at CNVs, we found a weak population structure, and most of the statistically different variants that matched with a transcribed gene, were not part of the chemical defensome and were more related to lipid metabolism, immune response and cell cycle. The same was observed with the variants correlated with the environmental variables. Additionally, we found a relevant variant at the Vitellogenin A gene which has been pointed out as a biomarker for endocrine disruption in fish. Finally, at the DNA methylation level in the anal fin, which is a stable tissue in terms of methylations, the epigenetic structure was weak and showed a similar pattern to the genetic structure. Concerning the differentially methylated genes and those associated with environmental variables, they were not part of the chemical defensome, and were related to cytoskeleton organization, carbohydrate metabolism and signal transduction. In general, most of the molecular pathways affected by pollution were not related to the chemical defensome, but related to processes like cell cycle (gene expression and CNVs), cytoskeletal organization, (gene expression and DNA methylation), or immune response (gene expression, CNVs and DNA methylation). We do not discard the participation of the chemical defensome, but apparently, in these populations is not the main mechanism. These results consolidate part of the research done in this species related to pollution, but further research should be done with a multiomics approach to fully characterize and confirm the responses reported in this thesis.

2025-01-01T00:00:00Z