Variación estacional de Salmonella enterica en heces de gaviota dominicana (Larus dominicanus) en la Región de Valparaíso y caracterización fenotípica y genotípica de las cepas con resistencia antimicrobiana

Abstract

Actualmente la importancia en salud pública de las bacterias del género Salmonella es ocasionada por el aumento de resistencia antimicrobiana que ha tenido en los últimos años, debido al inadecuado uso de antimicrobianos. La infección se asocia al consumo de alimentos contaminados, sin embargo, cobra importancia el rol de las aves silvestres como reservorios y agentes diseminadores de genes de resistencia a antimicrobianos en seres humanos y animales. A pesar de que la mayor cantidad de casos clínicos en seres humanos ocurren durante verano, pocos estudios reportan si existe estacionalidad en el aislamiento de cepas de Salmonella desde aves silvestres. El objetivo de esta Memoria fue determinar la existencia de variación estacional en la detección de cepas de S. enterica aisladas desde heces de Larus dominicanus de la Región de Valparaíso y caracterizar fenotípica y genotípicamente aquellas cepas con resistencia antimicrobiana. Se analizó un total de 608 muestras obtenidas mediante torulado de heces frescas tomadas directamente desde el ambiente. Las cepas aisladas fueron confirmadas mediantes la Reacción de la Polimerasa en Cadena (PCR) para el gen invA. Para determinar la asociación entre el aislamiento de cepas de Salmonella y la estación del año se utilizó el programa Infostat®. La determinación de fenotipos de resistencia se realizó mediante el método de difusión en placa (Kirby Bauer). Los perfiles genéticos fueron evaluados mediante un PCR para los genes: tet(A), tet(B), tet(G), blaPSE-1, blaTEM, blaCMY, aadB, aacC e integrones clase 1. Se aislaron 7 cepas de Salmonella que no fueron asociadas estadísticamente a la estación del año en que fueron obtenidas. Se encontró un total de 5 perfiles fenotípicos, y 2 perfiles genotípicos de resistencia antimicrobiana, siendo blaTEM el único gen encontrado en las cepas estudiadas. Aunque genotípicamente no coinciden los resultados, probablemente porque la resistencia encontrada a nivel fenotípico es codificada por otros genes no estudiados en esta Memoria, se evidencia el impacto que tienen las aves silvestres en la mantención y diseminación de bacterias resistentes a agentes antimicrobianos.

Nowadays, the importance in public health regarding the Salmonella genus bacteria is caused by the increase of the antimicrobial resistance in the last few years, given the injudicious use of antimicrobials. The infection is associated with the consumption of contaminated food, however, the role of wild birds takes an important place, for they behave as natural reservoirs and dissemination agents of resistance genes to antimicrobials in humans and animals. Despite that most of clinical cases in humans occur during the summer, little research has reported if there exists seasonality in the isolation of Salmonella strains from wild birds. The objective of this research was to determine the existence of seasonal variation in the detection of strains of S. enterica from faeces of Larus dominicanus in the Valparaíso Region, and, to characterise both phenotypically and genotypically those strains with antimicrobial resistance. A total of 608 fresh faecal samples were taken with swabs directly from the environment. The isolated strains were confirmed by the polymerase chain reaction (PCR) for the invA gene. To determine the association between the isolation of Salmonella strains and the season, the software Infostat® was used. The determination of resistance phenotypes was carried out by the agar diffusion test (Kirby Bauer). The genetic profiles were evaluated through PCR for the genes tet(A), tet(B), tet(G), blaPSE-1, blaTEM, blaCMY, aadB, aacC and class 1 integrons. Seven Salmonella strains were isolated, because they were not statistically associated with the season when they were taken. A total of 5 phenotypic profiles were found, as well as 2 genotypic profiles of antimicrobial resistance, being blaTEM the only gene found in the researched strains. Although the results do not match genotypically –probably perhaps the resistance found at a phenotypic level is codified by other genes which were not studied for this Project, the impact that wild birds have in the storage and spreading of bacteria resistant to antimicrobial agents is evident.