Estimación de la prevalencia y determinación de la variación estacional del virus influenza A en el Humedal Parque La Isla, Concón, Chile

Abstract

Los virus influenza tipo A (VIA) afectan a una gran cantidad de especies incluyendo seres humanos. Se reconoce a las aves silvestres como el principal reservorio de estos virus, particularmente aquellas pertenecientes a los órdenes Anseriformes y Charadriiformes, motivo por el cual resulta de gran importancia entender la dinámica de los VIA en estas poblaciones animales. Al respecto existe gran cantidad de información en países del hemisferio norte en el continente americano, situación que difiere de los países de Sudamérica. El presente estudio consistió en el desarrollo de actividades de vigilancia activa de los VIA durante el período de octubre 2015-agosto 2016 en las aves silvestres del Humedal Parque La Isla (HPLI) de la localidad de Concón, Chile. El objetivo de esta memoria fue determinar la presencia del virus, sus niveles de prevalencia y una posible estacionalidad de estos valores en el HPLI. Se tomó un total de 1.432 muestras de heces de aves, las cuales fueron analizadas mediante el método de Reacción en Cadena de la Polimerasa cuantitativa con Transcriptasa Reversa (RT-qPCR) para detectar el gen M del VIA. De esta manera se identificó la presencia del virus en el 75% de los meses estudiados, con una prevalencia total de 4,26%, donde el valor mínimo observado fue un 1,04% para los meses de marzo y julio, y un 14,58% en abril. También se logró establecer una asociación entre positividad a VIA y una estacionalidad en Verano-Otoño (VO) 2016 (p = 0,0004) por medio del modelo de Regresión Logística Simple, existiendo 3,02 veces más riesgo de encontrar positividad al virus mediante la prueba RT-qPCR durante los meses de esta temporada. Finalmente se pudo concluir que muchos factores no considerados en el estudio pudieron haber influido sobre estos resultados, tales como la especie a la que pertenecían las muestras y las variables climáticas, entre otras. También se pudo dilucidar la existencia de una gran brecha de información en países como Chile y la región de Sudamérica en general respecto a los VIA, es así como el presente estudio podría dar pie a futuras investigaciones que incorporen múltiples factores para llegar a comprender a mayor cabalidad la dinámica de los VIA en las poblaciones de aves silvestres de humedales como el HPLI de Concón

Influenza A viruses (VIA) affect a large number of species including humans. Wild birds are recognized as the main reservoir of these viruses, particularly those belonging to the orders Anseriformes and Charadriiformes, which is why it is very important to understand the dynamics of VIA in these animal populations. In this regard there is a great amount of information in countries of the Northern hemisphere in the American continent, a situation that differs from the countries of South America. The present study consisted of the development of active surveillance activities of the VIA during the period of October 2015-August 2016 in the wild birds of the La Isla Park Wetland (HPLI) of the town of Concón, Chile. The objective of this report was to determine the presence of the virus, its prevalence levels and a possible seasonality of these values in the HPLI. A total of 1432 samples of feces of birds were taken, which were analyzed by the Quantitative Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-qPCR) method to detect the M gene of VIA. In this way, the presence of the virus was identified in 75% of the months studied, with a total prevalence of 4.26%, where the minimum value observed was 1.04% for the months of March and July, and 14.58% in April. It was also possible to establish an association between VIA positivity and seasonality in Summer-Autumn (VO) 2016 (p = 0.0004) by means of the Simple Logistic Regression model, being 3.02 times more risk of finding positivity to the virus through the RT-qPCR test during the months of this season. Finally, it was concluded that many factors not considered in the study could have influenced these results, such as the species to which the samples belonged and the climatic variables, among others. It was also possible to elucidate the existence of a large information gap in countries such as Chile and the South American region in general with respect to VIA, this is how the present study could lead to future research that incorporates multiple factors to reach a greater understanding of the dynamics of VIA in wild bird populations of wetlands such as Concón's HPLI