Caracterización epidemiológica de Salmonella entérica y Escherichia coli shigatoxigénica en sistemas productivos de traspatio en la región metropolitana, año 2019

Abstract

En la región Metropolitana de Chile se registran 3.836 sistemas productivos de traspatio (SPT), caracterizados por ser sistemas pequeños, con escasa asistencia veterinaria y medidas de bioseguridad. Estos sistemas pueden actuar como mantenedores y diseminadores de patógenos zoonóticos, como Salmonella spp. y Escherichia coli shigatoxigénica (STEC), cuya prevalencia y circulación en SPT no está totalmente caracterizada. El objetivo de esta Memoria de Título fue determinar la positividad para ambos agentes en SPT, estableciendo factores de riesgo relacionados con su presencia. En cada SPT se aplicó una encuesta epidemiológica y se recolectaron muestras de heces para detectar los patógenos. Estas fueron procesadas mediante cultivo bacteriológico para ambos agentes, y confirmadas mediante PCR convencional. Posteriormente se realizaron modelos de regresión logística multivariable para establecer los factores de riesgo asociados a positividad. Se reportaron prevalencias de 4,7% para Salmonella spp. y 11,47% para STEC en la región. Los SPT son manejados mayoritariamente por pensionados, mantienen diversas especies, carecen de bioseguridad y asesoría veterinaria privada o pública. El análisis epidemiológico concluyó que, intercambiar huevos embrionados (p=0,021; OR 39), mantener aves con el pico cortado (p=0,001; OR 156), la diversidad biológica (Índice Gini-Simpson) (p=0,03; OR 1,717), cercanía con planteles comerciales (p=0,019; OR 20,645) y la calidad de usuario de INDAP o PRODESAL (p=0,023; OR 15,026) son factores que aumentan el riesgo de positividad. Por otro lado, el tipo de confinamiento (p=0,002; OR 0,019) lo disminuye. La bioseguridad y asistencia veterinaria en los SPT son clave para prevenir brotes de enfermedades en poblaciones de alto riesgo

In Metropolitana region, Chile, 3,836 backyard production systems (BPS) are registered, characterized by being small systems, with low veterinary assistance and biosecurity measures. These systems could act as maintainers and disseminators of zoonotic pathogens, such as Salmonella spp. and shiga-toxin producing Escherichia coli (STEC), whose prevalence and circulation in SPT are not fully characterized. The aim of this Undergraduate thesis was to determine positivity for both agents in SPT, establishing risk factors related to their presence. An epidemiological survey was applied to each BPS where stool samples were collected to detect these pathogens. Samples were processed by bacteriological culture for both agents, confirmed by conventional PCR. Subsequently, multivariable logistic regression models were performed to establish the risk factors associated with positivity. Prevalence of 4.7% were reported for Salmonella spp. and 11.47% for STEC in the region. The BPS are mainly managed by pensioners, maintaining various species, with a lack biosecurity and private/public veterinary advice. The epidemiological analysis concluded that exchanging embryonated eggs (p = 0.021; OR 39), keeping birds with their beaks cut off (p = 0.001; OR 156), biological diversity (Gini-Simpson Index) (p = 0.03; OR 1,717), proximity to intensive poultry/swine production (p = 0.019; OR 20,645) and the quality of be user of INDAP or PRODESAL (p = 0.023; OR 15,026) are factors that increase the risk of positivity. In contrast, the type of confinement (p = 0.002; OR 0.019) decreases it. Biosecurity and veterinary assistance in BPS are key factors to prevent disease outbreaks in high-risk populations