Identificación de las especies de aves silvestres costeras portadoras de Virus Influenza Aviar

Abstract

Los reservorios naturales del virus influenza aviar (VIA) son las aves acuáticas, principalmente aquellas pertenecientes al orden Charadriiformes y Anseriformes. A pesar de recibir una gran cantidad de aves migratorias durante primavera-verano, pocas especies Charadriiformes (11) son reconocidas como reservorios del VIA en Chile. El objetivo de este estudio es describir nuevos hospederos del VIA del orden Charadriiformes en Chile y describir aquellas especies de aves costeras hospederas del VIA que se encuentran en literatura y bases de datos en Chile y Sudamérica. Desde enero 2020 a diciembre 2021, heces frescas de aves silvestres fueron colectadas desde diferentes humedales de Chile, todos los sitios son reconocidos como áreas importantes de congregación de aves en Chile. Para la identificación de los hospederos, las muestras positivas a VIA fueron analizadas por códigos de barra mediante secuenciación del gen mitocondrial citocromo C oxidasa I (COI). Las especies fueron asignadas mediante BLAST y BOLD. A través de este proyecto de investigación fue posible identificar una nueva especie hospedera del VIA para Chile y Sudamérica Charadrius semipalmatus, especie migratoria interhemisferica que visita nuestro país en primavera-verano. Este estudio sugiere que la especie mas prevalente identificada como hospedera del VIA es Larus dominicanus, una especie que está cercanamente relacionada a las actividades humanas por lo que representa un potencial factor de riesgo de zoonosis y para diseminar el virus a otros animales. Estos resultados resaltan la importancia de continuar con vigilancia active y la identificación de nuevos especies hospederas para estar atentos a posibles pandemias y para entender más la ecología del VIA en la región

The natural reservoir of avian influenza viruses (AIV) are wild aquatic birds, mainly those belonging to the order Charadriiformes and Anseriformes. Despite of receiving a plethora of migratory birds during the southern spring migration, only a few species Charadriiformes (11) are recognized as reservoirs of IAV in Chile. The aim of this study is to describe new host AIV species of the order Charadriiformes in Chile and described so far in the literature and in databases the species of shorebirds that are host of the AIV in Chile and South America. From January 2020 to December 2021, fresh feces of wild birds were collected from different wetlands across Chile. All sampled sites are recognized as important areas of wild bird concentration in Chile. For the identification of host species, AIV positive samples were analyzed by genetic barcoding by sequencing the mitochondrial cytochrome C oxidase I gene (COI). Host species were assigned by BLAST and BOLD. Through this research project it has been possible to identify a new AIV host species for Chile and South America, Charadrius semipalmatus, an interhemispheric migratory species that visit our country in spring-summer. This study suggests that the most prevalent species identified as the host of AIV is Larus dominicanus a species which is closely related to human activities which is why it represents a potential risk factor for zoonoses and for the spread of the virus to other groups of animals. These results highlight the importance of continuing active surveillance and the identification of new host species to be alert to potential outbreaks and to understand the ecology of AIV in the South American region