Caracterización epidemiológica de Escherichia coli shigatoxigénica en sistemas productivos de traspatio de la Región de Valparaíso, año 2019-2020

Abstract

En la Región de Valparaíso existen 6.104 explotaciones agropecuarias, una gran parte de estas corresponden a sistemas productivos de traspatio (SPT), caracterizándose por tener reducidas o nulas medidas de bioseguridad, en la mayoría de los casos no tener asesoría veterinaria, escasa tecnificación y bajos recursos económicos destinados al mejoramiento y mantención de las instalaciones y equipamiento necesario para sus actividades. Estas características representan un potencial riesgo no solo para la salud de los animales que conforman el plantel, sino que también para la salud pública, donde estas producciones de pequeña escala pueden ser reservorios y transmisores de agentes patógenos zoonóticos, por ejemplo, Escherichia coli shigatoxigénica (STEC). La finalidad de esta memoria de título es caracterizar los SPT, calcular la tasa de positividad de la bacteria y determinar los factores de riesgo para su presencia en los SPT de la Región de Valparaíso. Este análisis se logró gracias a tener acceso a muestras fecales recolectadas en 2019 - 2020 y encuestas epidemiológicas de productores de Valparaíso. Dichas muestras fueron cultivadas y confirmada la presencia del agente mediante PCR, en donde se presentó una tasa de positividad del 18,52% a nivel regional. Los SPT tuvieron características muy similares entre sí, respecto a manejos, medidas de higiene, y utensilios de uso diario. Con un modelo de regresión logística multivariada se revelaron los factores de riesgos asociados a la presencia de la bacteria en los predios. Según dicho modelo se reporta que el número de bovinos presentes en el SPT (OR = 1,394; p = 0,037) y que sea una mujer la encargada del manejo de los SPT (OR = 9,435; p = 0,043), son factores que incrementan el riesgo de ser positivo a STEC. Este estudio entrega información relevante para la salud humana y animal acerca de la presencia de STEC en animales productivos presentes en los SPT de la Región de Valparaíso.

There are 6,104 farms in Valparaíso region, a large part of them correspond to backyard production systems (BPS), characterized by reduced or no biosecurity measures, in most cases not having veterinary advice, low technology and low economic resources for the improvement and maintenance of the facilities and equipment necessary for their activities. These characteristics represent a potential risk not only for the health of the animals that make up the farm, but also for public health, where these small-scale productions can be reservoirs and transmitters of zoonotic pathogens, such as shiga-toxin producing Escherichia coli (STEC). The purpose of this thesis is to characterize the BPS, calculate the positivity rate of the bacterium and determine the risk factors for its presence in the BPS of the Valparaíso region. This analysis was achieved by having access to fecal samples collected in 2019 - 2020 and epidemiological surveys of producers in Valparaíso. These samples were cultured, and the presence of the agent was confirmed by conventional PCR, which showed a positivity rate of 18.52% at the regional level. The BPS had very similar characteristics to each other, with respect to management, hygiene measures, and utensils for daily use. A multivariable logistic regression model was used to reveal the risk factors associated with the presence of the bacterium in the BPS. According to the model, it is reported that the number of cattle present in the BPS (OR = 1.394; p = 0.037) and that a woman oversees BPS management (OR = 9.435; p = 0.043), are factors that increase the risk of being STEC positive. This study provides relevant information for human and animal health about the presence of STEC in productive animals raised on BPSs from Valparaíso region.