Evaluación del DNA bacteriano como marcador genético de poblaciones humanas

Abstract

La diversidad biológica humana abordada desde una perspectiva molecular ha sido clásicamente estudiada utilizando marcadores en el genoma o proteoma humano (Stoneking, 1997). Sin embargo, el análisis de distintos organismos asociados a la especie humana ha demostrado tener un gran potencial para inferir eventos migratorios recientes o evaluar las relaciones genéticas entre las poblaciones hospederas. El cuerpo humano es colonizado por una numerosa cantidad y diversidad de microorganismos, que conforman su flora normal y patológica. La profundidad temporal y persistencia de esta relación ha permitido la utilización de ciertos organismos como estimadores indirectos de la historia micro-evolutiva de sus hospederos. El objetivo de este trabajo es contribuir a la utilización de la flora bacteriana humana como marcador genético indirecto de sus hospederos, evaluando específicamente la amplia diversidad bacteriana de la cavidad oral. Para ello se planteó analizar bacterias orales en contextos arqueológicos, utilizando como fuente de DNA el cálculo dental acumulado en vida sobre las superficies dentales de los individuos. Sin embargo, la diversidad genética de las bacterias orales y su aptitud como marcadores genéticos de los hospederos no han sido ampliamente investigadas (Caufield, 2009; Nasidze et al, 2009), mientras que la composición bacteriana del tártaro sólo ha sido evaluado mediante técnicas de microscopia (Vandermeersch et al, 1994; Pap et al, 1995; Linossier et al, 1996). Este estudio constituye una primera aproximación a la composición bacteriana del tártaro dental utilizando técnicas moleculares, considerando la frecuencia y variabilidad genética de cinco bacterias en muestras actuales y antiguas. Los resultados permitieron identificar a la especie bacteriana más adecuada -por frecuencia y variabilidad- para posteriores investigaciones, enfocadas en analizar su variación genética y efectividad como estimador indirecto de la historia micro-evolutiva humana, desde contextos antiguos y actuales. Además, se consiguió definir y validar un protocolo de extracción de DNA desde tártaro, ajustando los parámetros para la amplificación de genes bacterianos en restos prehistóricos.