Author | dc.contributor.author | Farfán Urzúa, Mauricio | |
Author | dc.contributor.author | Torres Torretti, Juan Pablo | |
Author | dc.contributor.author | O'Ryan Gallardo, Miguel | |
Author | dc.contributor.author | Olivares Morales, Mauricio | |
Author | dc.contributor.author | Gallardo Schall, Pablo | |
Author | dc.contributor.author | Lastra Torres, Jorge | |
Author | dc.contributor.author | Salas Palma, Carolina | |
Admission date | dc.date.accessioned | 2020-11-30T21:08:30Z | |
Available date | dc.date.available | 2020-11-30T21:08:30Z | |
Publication date | dc.date.issued | 2020 | |
Cita de ítem | dc.identifier.citation | Rev Chilena Infectol 37 (2020): 281-286 | es_ES |
Identifier | dc.identifier.issn | 0716-1018 | |
Identifier | dc.identifier.uri | https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/177931 | |
Abstract | dc.description.abstract | The global shortage of reagents and kits for nucleic acid extraction and molecular detection of SARS-CoV-2 requires new cost-effective strategies for the diagnosis of suspected COVID-19 cases, especially in countries that need to increase detection capacity. Pooled nucleic acid testing has been extensively used as a cost-effective strategy for HIV HepB, HepC and influenza. Also, protocols dispensing of RNA extraction appears as an attractive option for detection of SARS-CoV-2. In this study, we found that pooling of 5 samples showed that C-T variations were in the range of 1.0-4,5 units, with less likelihood of a false negative result. Results of the sample without nucleic acid extraction, was unsatisfactory, with a significant increase in C-T values, and thus for risk of a false negative result. In conclusion, pooling nasopharyngeal samples with both automated and manual extraction proved reliable, and thus a potential efficient alternative for the diagnosis of suspected COVID-19 in developing countries. | es_ES |
Abstract | dc.description.abstract | La escasez mundial de reactivos para la extracción de ácidos
nucleicos y la detección molecular de SARS-CoV-2 requiere de
nuevas estrategias de mayor rendimiento para el diagnóstico de casos
sospechosos de COVID-19, especialmente en países que necesitan
aumentar su capacidad diagnóstica. La detección de ácidos nucleicos
en muestras agrupadas o pool testing se ha utilizado ampliamente
como una estrategia costo-efectiva para el VIH, hepatitis B, hepatitis C e influenza. Adicionalmente, los protocolos que no requieren
extracción de ARN aparecen como una opción para la detección de
SARS-CoV-2. En este trabajo, presentamos los resultados de una
estrategia detección de SARS-CoV-2 en muestras agrupadas, que
incluye diferentes métodos de extracción de ARN que puede ser una
estrategia atractiva para los países en desarrollo. La agrupación de 5
muestras mostró variaciones CT en el rango de 1,0 a 4,5 unidades, con
una baja probabilidad de obtener falsos negativos, a diferencias de los
resultados agregando muestras agrupadas directamente en la reacción
de amplificación de SARS-CoV-2. En conclusión, la agrupación de
muestras nasofaríngeas, demostró ser un método confiable y, por lo
tanto, una alternativa para aumentar el rendimiento en el diagnóstico
de COVID-19 para países en desarrollo. | es_ES |
Lenguage | dc.language.iso | es | es_ES |
Publisher | dc.publisher | Sociedad Chilena de Infectología | es_ES |
Type of license | dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Chile | * |
Link to License | dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/cl/ | * |
Source | dc.source | Revista Chilena de Infectología | es_ES |
Keywords | dc.subject | COVID-19 (Enfermedad) | es_ES |
Keywords | dc.subject | Coronavirus | es_ES |
Keywords | dc.subject | SARS-CoV-2 | es_ES |
Keywords | dc.subject | Diagnosis | es_ES |
Keywords | dc.subject | Pool testing | es_ES |
Keywords | dc.subject | Diagnóstico | es_ES |
Keywords | dc.subject | Muestras agrupadas | es_ES |
Título | dc.title | Optimización de la detección de SARS-CoV-2 mediante el análisis de muestras agrupadas | es_ES |
Title in another language | dc.title.alternative | Optimizing RT-PCR detection of SARS-CoV-2 for developing countries using pool testing | es_ES |
Document type | dc.type | Artículo de revista | |
dcterms.accessRights | dcterms.accessRights | Acceso Abierto | |
Cataloguer | uchile.catalogador | apc | es_ES |
Indexation | uchile.index | Artículo de publicación ISI | es_ES |