Análisis de interacción de los polimorfismos CA-SSR-I, -216G>T, y R497K del gen EGFR, estado funcional del gen oipa y su relación con cáncer gástrico

Abstract

El cáncer gástrico representa la tercera causa de mortalidad por cáncer en el mundo. La infección por Helicobacter pylori se relaciona con cáncer gástrico. Entre los factores de virulencia de esta bacteria se encuentra la proteína externa de membrana oipA. La expresión de la proteína activa oipA depende del número de repeticiones de dinucleótido CT en la región codificante 5´ del gen. OipA activa la vía de señalización EGFR-PI3K. EGFR se encuentra sobre expresado en cáncer gástrico y la amplificación de su gen se correlaciona con un pobre pronóstico de la enfermedad. En esta tesis se estudió la asociación con cáncer gástrico e interacción entre los polimorfismos CA-SSR-I, -216G>T, y R497K del gen EGFR, y la presencia del gen oipA de H.pylori en est controles. El estado funcional de oipA se determinó mediante secuenciación. Se genotipificaron los polimorfismos propuestos mediante el ensayo 5'Exonucleasa (Taqman®) [R497K], RFLP [-216G>T] y electroforesis capilar [CA-SSR-I]. Los oipA de H. pylori se asoció con cáncer gástrico (p<0,0001, OR: 9,82 [IC95% 3,25-29,62]). Esta asociación predominó en los tumores de alto grado histológico (OR: 25,71 [IC95%3,36-196,63]). Las variantes CA-SSR-I, R497K y -216G/T del gen EGFR no se asociaron con cáncer gástrico. Sin embargo se sugiere interacción entre OipA "on" y los polimorfismos R497K (OR: 2,35 [IC95 %1,18-4,70]) y -216G/T (OR: 4,73 [IC95% 1,00-22,34]).

Gastric cancer is the third leading cause of cancer mortality in the world. Infection with Helicobacter pylori is associated with this cancer. Outer membrane protein oipA is an H.pylori virulence factor. The expression of the active form of oipA depends on the number of CT dinucleotide repeats coding region. This virulence factor activates the EGFR-PI3K signaling pathway. EGFR gene is overexpressed in gastric cancer and its amplification correlates with poor prognosis. In this study, we analyzed the association with gastric cancer and interaction between the CA-SSR-I, -216G/T and R497K polymorphisms of the EGFR gene, and the oipA functional status "on", through a study of 147 cases and 160 controls. OipA functional status was analyzed by sequencing. Genotyping was performed by 5'exonuclease assay (Taqman ®) for R497K, RFLP for -216G/T and capillary electrophoresis for CA SSR-I. The results indicated that functional status "on" was associated with increased risk of gastric cancer (p<0.0001, OR: 9.82 [95%CI 3.25 to 29.62]). This association was predominant in high grade tumors (OR: 25.71 [95%CI 3.36 to 196.63]). The CA SSR -I, R497K and -216G>T polymorphisms was not associated with gastric cancer. However an interaction between oipA "on" and the SNPs R497K (OR: 2.35 [95%CI 1.18 to 4.70]) and -216G/T (OR: 4.73 [95%CI 1.00 to 22.34]) is proposed.