Modelo referencial para la generación de reporte interoperable para el diagnóstico de bacterias multirresistentes de importancia en salud pública

Abstract

El laboratorio clínico (LC) cumple un papel fundamental en la vigilancia epidemiológica y se encuentra encargado de la notificación oportuna de varias enfermedades que pueden poner el riesgo la salud de la población. Hoy en día, los laboratorios clínicos (LCs) de Chile están en un proceso de marcha blanca para la implementación de la notificación de bacterias de importancia para la salud pública, debido al incremento mundial de la resistencia a antimicrobianos. Actualmente el proceso de vigilancia de resistencia antimicrobiana es escaso. La implementación de la interoperabilidad en los sistemas de salud y especialmente en los laboratorios permitiría reducir los tiempos de notificación de las resistencias antimicrobianas, con la generación de alertas tempranas en el sistema hospitalario y además propiciaría la mejor utilización de los datos contenidos en el reporte diagnóstico, siendo un real aporte en el control y vigilancia epidemiológica. Para generar un reporte interoperable de LC es necesaria la adopción de terminología estándar internacional. Para ello, se requiere de personal especializado, con conocimiento de LC e informática en salud, de modo de realizar un correcto mapeo de los exámenes y diagnósticos de laboratorio con una semántica y sintáctica adecuada para alcanzar niveles de interoperabilidad elevados. Dentro de los estándares de terminología encontramos; “Nombres y Códigos de Identificadores de Observación Lógica” (LOINC®) y “Nomenclatura sistematizada de términos clínicos de medicina” (SNOMED-CT), los cuales son utilizados para la codificación y resultados de LC respectivamente. Estos estándares terminológicos han sido adoptados por el estándar de mensajería HL7. En Chile los exámenes de laboratorio aún no son interoperables a pesar de la disponibilidad de herramientas validadas a nivel mundial. Por este motivo, se generó un modelo referencial que sienta las bases para la futura implementación de un reporte interoperable para notificación de bacterias resistentes a antibióticos de importancia en salud pública (ARAISP). El modelo referencial contempla las etapas de modelado del proceso y mapeo a terminología estándar (LOINC, SNOMED-CT y HL7-FHIR) de un conjunto de exámenes microbiológicos que permiten el diagnóstico de ARAISP.

The Clinical Laboratory have a critical role to play in epidemiological surveillance and this function is the timely notification of infectious diseases that can put the population ́s health at risk. Actuality, the Clinical Laboratories in Chile are in the trial process for the implementation of a bacterial resistance report, powered by the Mundial increase of antimicrobial resistance. Currently, the surveillance process is poor. The interoperability implementation on systems and laboratories health ́s could reduce the notify time ́s of bacterial resistance, with the generation of early alerts in the clinical system and this improves the use of data stored in the diagnostic report and can be a great contribution to control and epidemiological surveillance. The implementation of interoperable Clinical Laboratories requires the use of international standard terminology. For mapping to standard terminology is required professionals with knowledge of LC and health informatics for the correct mapping of laboratory tests and diagnoses with semantics and syntax that contribute to achieving high levels of interoperability. Commonly used terminology standards in health are "Logical Observation Identifier Names and Codes" (LOINC) and "Systematized Nomenclature of Medicine-Clinical Terms" (SNOMED-CT), which are used for the coding of clinical laboratory tests and diagnostic results. These terminology standards have been adopted by the HL7 messaging standard. In Chile, laboratory tests are not yet interoperable despite the availability of tools used and validated worldwide. Therefore, a reference model was generated that lays the foundations for the future implementation of an interoperable report for the bacteria resistance notification (ARAISP). The reference model contemplates the stages of modeling the process and mapping to standard terminology (LOINC, SNOMED-CT, and HL7-FHIR) about microbiological tests that allow the diagnosis of ARAISP.