Estudio de la especifidad por tRNA de la GluRS de acidithiobacillus ferrooxidans en la formación del GIN -Trna gin por la vía indirecta

Abstract

La aminoacilación especifica de los tRNA es catalizada por las aminoacil-tRNA sintetasas (AARSs), las cuales deben discriminar y distinguir entre múltiples aminoácidos y tRNAs sustratos. Existen dos vías en la formación de Gln-tRNAGln. La vía d¡recta, presente en eucariontes y en algunas bacterias que involucra Ia participación de una GInRS que forma el Gln-tRNAcln y la vía indirecta, presente en arqueas y en la mayoría de las bacterias. En la vía indirecta una GluRS-ND forma Glu-tRNAGlu y GlutRNAGln. Este ultimo que es un aminoacil-tRNA "mal acilado" se transforma en GlntRNAGln por la acción de una a midotransferasa dependiente de tRNA. En esta tesis surgió la pregunta écuáles son los determ¡nantes moleculares involucrados en la interacción entre los tRNAs sustratos y las enzimas en la vía indirecta?, que se abordó mediante la identificación de los residuos aminoacídicos en la AFGIuRS1 y AFGIuRS2 de A. Jerrooxidons que interaccionan con los tRNAs (Glu y Gln). Con el modelamiento por homología, se predijeron las estructuras de ambas GluRSs. Se identifico una R351 en la AFGIURS1 y se construyo un modelo de la mutante de la AFGIuRS1 (R351Q) con el tRNAclu de brazo D largo. El análisis bioinformático revelo que no se observan cambios importantes a nivel de los dominios catalíticos de la GluRS. Sin embargo, el rearreglo estructural relevante ocurre en los dominios de interacción con el anticodón del IRNA. El mayor cambio es de 7A' en la G337. Para identificar diferencias y similitudes entre la AFGIuRSl1y la AFGluRS2, se construyeron los modelos de la AFGIuRS2 con los tRNAGI'