Análisis filogeográfico del sapo andino Telmatobius chusmisensis (Anura: telmatobiidae )
Professor Advisor
dc.contributor.advisor
Méndez, Marco
Author
dc.contributor.author
Otálora Acevedo, Katherin Eliana Alejandra
Associate professor
dc.contributor.other
Hinojosa, Luis Felipe
Admission date
dc.date.accessioned
2022-12-01T18:36:39Z
Available date
dc.date.available
2022-12-01T18:36:39Z
Publication date
dc.date.issued
2017
Identifier
dc.identifier.uri
https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/189553
Abstract
dc.description.abstract
La hidrografía del altiplano chileno se caracteriza por ser muy compleja, debido
a las intensas fluctuaciones estacionales y a efectos de glaciaciones del
Pleistoceno, que han generado un alto grado de endemismo en el área. Uno de
los componentes endémicos de esta zona es el anfibio Telmatobius
chusmisensis (Telmatobiidae) (Formas et al., 2006) un sapo estrictamente
acuático, que tiene una distribución entre los 19° y 21° S. Este rango de
distribución presenta un amplio gradiente altitudinal y latitudinal del altiplano
chileno. En este estudio se evalúa la existencia de estructuración genética y
filogeográfica en T. chusmisensis, y la existencia de cambios en el tamaño
efectivo poblacional en el tiempo. Para esto, se secuenciaron 811 pb del gen
mitocondrial Dloop y se genotipificaron 8 loci microsatélites, en 205
especímenes en 13 localidades. Para determinar la variabilidad intra e interpoblacional de T. chusmisensis se construyó una red de haplotipos y se
calcularon los índices de diversidad genética. Posteriormente, se estimó el
número de poblaciones mediante un análisis de estructuración genética
utilizando SAMOVA, GENELAND y STRUCTURE. La historia demográfica de
las poblaciones se evaluó mediante los índices demográficos y se realizó un
Skyline Plot. Telmatobius chusmisensis presentó cinco grupos genéticos con el
marcador mitocondrial y seis grupos genéticos con los marcadores nucleares,
esos patrones se explican por el aislamiento geográfico entre las subcuencas,
la restricción al sitio de origen dada la baja vagilidad de estos organismos y su
alta dependencia a los sistemas acuáticos. Por otro lado, los datos de DNA mitocondrial revelaron un patrón filogeográfico claro con separación moderada
entre las poblaciones del norte y del sur. Se identificó una expansión
demográfica reciente para uno de los grupos más meridionales (Subcuenca
Quebrada de Tarapacá), presumiblemente debido las fluctuaciones ambientales
entre periodos secos y húmedos en el altiplano, durante y luego del último
período glacial 20000-7000 años BP. Los análisis de flujo genético
contemporáneo dan evidencia de flujo dentro de las subcuencas y entre dos
subcuencas latitudinalmente cercanas (Subcuenca Quipisca y Tarapacá) que
estaría mediado por eventos de dispersión actuales generados por el Monzón
sudamericano y ENSO, que permite el flujo asimétrico desde zonas de mayor
altitud a zonas de menor altitud. Los eventos de dispersión históricos estarían
atribuidos al CAPE por aumentos en la precipitación que fomentarían el flujo
genético entre subcuencas (Tarapacá y Aroma). La subcuenca de Tarapacá
presumiblemente habría actuado como una población fuente. La distancia
geográfica entre subcuencas jugó un rol importante como barrera geográfica en
la restricción parcial del flujo de genes en esta especie. Un grupo independiente
y nuevo (Subcuenca Loa Medio) se reporta para Telmatobius chusmisensis, que
estaría en proceso de diferenciación por lo cual toma gran importancia en
términos de conservación. Este es el primer estudio de la estructura genética
de esta especie.
Abstract
dc.description.abstract
The hydrography of the Chilean highland is characterized by being complex due
to intense seasonal fluctuations and the effects of Pleistocene glaciations, which
have generated a high degree of endemism in this area. Telmatobius
chusmisensis (Telmatobiidae) is an endemic amphibian to this zone (Formas et
al., 2006), that is strictly aquatic, inhabiting between 19° and 21° S. This range
of distribution presents a great altitudinal and latitudinal gradient of the Chilean
highland. This study evaluates the existence of a genetic and phylogeographic
structure in T. chusmisensis, and the presence of a change in effective population
size over time. We sequenced 811 bp of the mitochondrial Dloop gene, and
genotyped 8 microsatellite loci in 205 specimens from 13 locations. We
determined the intra- and inter-population variability of T. chusmisensis, built a
network of haplotypes and calculated genetic diversity indexes. Subsequently, the
number of populations by a genetic structuring analysis was estimated using
SAMOVA, GENELAND and STRUCTURE. The demographic history of
populations was evaluated using demographic indices and Skyline Plot.
Telmatobius chusmisensis, presented five genetic groups with the mitochondrial
marker, and six genetic groups with nuclear markers, these patterns are explained
by geographical isolation among the sub-basins, the restriction to the site of origin
due to low vagility of these organisms. Moreover, mitochondrial DNA data
revealed a phylogeographic pattern with a moderate separation between northern
and southern populations. A recent demographic expansion was identified for the
most southern group (Quebrada de Tarapacá), presumably due to environmental fluctuations between dry and wet periods in the highlands during and after the last
glacial period 14000-7000 BP years. The analyzes of contemporary genetic flow
provide evidence of flow within the sub-basins and between two latitudinally close
sub-basins (Quipisca and Tarapacá Sub-basin), that would be mediated by
current dispersion events generated by the South American Monsoon and ENSO,
which allows asymmetric flow from higher altitude zones to lower altitude areas.
The historical dispersal events would be attributed to CAPE, due to an increase
in precipitation that promoted genetic flow between sub-basins (Tarapacá and
Aroma). The Tarapacá sub-basin would presumably have acted as a source
population. Geographic distance between sub-basins played an important role as
a geographical barrier in the partial restriction of gene flow in this species. We
reported an independent and new group (Medium Loa Sub-basin) for Telmatobius
chusmisensis, which would be in a process of differentiation and would have a
great importance in terms of conservation. This is the first study of genetic
structure for this species.
Lenguage
dc.language.iso
es
es_ES
Publisher
dc.publisher
Universidad de Chile
es_ES
Type of license
dc.rights
Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States