Marcadores SNPS para rasgos de crecimiento en genes diferencialmente expresados como respuesta a dietas con inclusión de nutrientes vegetales en trucha arcoíris (oncorhynchus mykiss)

Abstract

En la acuicultura, el cultivo de salmónidos y en especifico de la Trucha arcoíris, se basa en dietas formuladas con harina y aceite de pescado. Para la industria, el ítem alimentación tiene un fuerte impacto por su alto costo, debido al uso extensivo de este dos insumos. Actualmente se están desarrollando dietas remplazando las proteínas y aceites de pescado por otras de origen vegetal, las cuales han mostrado su viabilidad. Aun cuando se desconoce la base genética que subyace a la tolerancia u adaptacion al consumo de dietas con reemplazo de nutrientes, ha sido posible identificar genes candidatos diferencialmente expresados en respuesta al uso de nuevas dietas que incorporan proteínas y aceites de origen vegetal. En los cuales a su vez, se han identificado marcadores moleculares de tipo SNP ("Single Nucleotide Polymorphism"), Utilizando una poblacion genealogizada de 59 familias (n=499), se midio el crecimiento en ejemplares alimentados con dieta de reemplazo de lípidos, proteínas y una dieta control (sin reemplazo de harina y aceite de pescado por componentes vegetales), durante 60 y 90 días. Se estimaron ganancia de peso, tasas de crecimiento y valores de cría para estas variables. Se realizo un análisis de asociacion basado en familias para 10 marcadores SNP con los valores de cría para cada una de las variables, usando el paquete para R: GWAF ("Genome-Wide Association analyses with Family data"). Los SNP fueron genopificados usando análisis de HRM ("High Resolution Melting"). Los resultados muestran que familias alimentadas con la dieta con reemplazo de proteínas muestran mayor tasa de crecimiento en relaci6n a] reemplazo de lípidos y la dieta control sin reemplazo (P=0,0124). El análisis de asociaci6n muestra que 5 SNP asocian con rasgos de crecimiento, encontrándose en los genes: sf3ga/3 , nudi77, af///, pgam5 y gonf4a, Ios cuales participan de diversas vias metab6licas