Validación de SNPS para el desarrollo de estrategias de estudios de asociación genómica, en salmones
Professor Advisor
dc.contributor.advisor
Allende, Miguel
Author
dc.contributor.author
Rodríguez Piccoli, Guillermo Antonio
Admission date
dc.date.accessioned
2022-11-10T13:28:45Z
Available date
dc.date.available
2022-11-10T13:28:45Z
Publication date
dc.date.issued
2013
Identifier
dc.identifier.uri
https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/189114
Abstract
dc.description.abstract
El salmón del Atlántico (Salmo salár constituye uno de los productos de exportación
más importantes parachile y Noruega, por lo que su estudio y mejoramiento es crucial
para el desarrollo de ambas economías. Esto puede ser llevado a cabo mediante
herramientas moleculares, tales como marcadores genéticos (SNps), que han
demostrado su efectividad en la selección genómica asistida para el mejoramiento de
otras especies (Closter, Elferink, et al.. 2010). Este tipo de análisis requiere de un
conjunto de SNPsde alta densidad donde cada loci del genoma se encuentre en
desequilibrio de ligamiento con a Io menos uno de estos(Hayes and Goddard,20iO),
haciendo esencial la correcta caracterización y clasificación de cada marcador
presente en el genoma. Las múltiples duplicaciones del genoma del salmón (S0% de
las secuencias codificantes) (Davey et al.,2OA1a, Utter et al., 1973),hacen necesaria la
exclusión de las abundantes estructuras polimórficas presentes en regiones parálogas
de su genoma (PSVS), y la caracterización de SNPS presentes en estas zonas (MSvs)
para la elección de aquellos polimorfismos con alta conservación (Hardy-Weinberg
principle), que constituyan marcadores eficientes para la selección genómica. Hasta el
momento no existen acercamientos para resolver esta problemática a prior¡
significando altos costos y tiempos asociados a Ia clasificación, la cual no siempre es
efectiva.Es por esto que proponemos lograr esto mediante la clasifjcación de los
pol¡morfismos de múltiples individuos (MlVs) de acuerdo alos niveles de conservación
de las regiones en las que se encuentran.
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Patrocinador
dc.description.sponsorship
empresa AQUAINNOVO S.A.,y el
gobierno de Chile con el Fondo de Financiamiento de Centros de excelencia en
investigación (FONDAP) y las becas de la Comisión Nacional de Investigación
Científica y Tecnológica de Chile(CONICYT),que hicieron posible financiar el presente
proyecto de investigación; y finalmente a Ben Koop de CGRASP
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Lenguage
dc.language.iso
es
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Publisher
dc.publisher
Universidad de Chile
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Type of license
dc.rights
Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States