Diseño de Servicios en Patología Digital: Propuesta de Valor para Apoyar la Labor Diagnóstica
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2023Metadata
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Härtel, Steffen
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Diseño de Servicios en Patología Digital: Propuesta de Valor para Apoyar la Labor Diagnóstica
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Abstract
El cáncer es una de las principales causas de mortalidad a nivel mundial, siendo la primera en
Chile, y en donde se prevé un aumento del 60% en los próximos 20 años. Así mismo, los
exámenes de Anatomía Patológica (AP) han aumentado, conllevando una sobrecarga de trabajo
para los patólogos. Además, se ha evidenciado cierto grado de variabilidad en el diagnóstico.
Por ejemplo, en cáncer de colon la variabilidad interobservador es moderada (κ = 0.59), e
intraobservador menor (κ = 0.71) pero con un cambio del diagnóstico entre 3 hasta 30% de los
casos. El diagnóstico correcto y oportuno es crítico para los pacientes que inician tratamientos
agresivos. A partir de esto surge la interrogante ¿Cómo apoyamos la labor diagnóstica de
patólogos/as y mejoramos sus condiciones de trabajo?
La Patología Digital (PD) es el estudio de placas virtuales, que al incorporar Inteligencia
Artificial (IA), adquiere el potencial de apoyar la labor diagnóstica mediante el análisis de
imágenes digitales de biopsia, implementando Sistemas de Soporte a la Decisión Clínica
(SSDC). En particular, durante los años 2020 y 2021 el proyecto FONDEF ID19|10334
DeepPathology, generó una plataforma de PD, con componentes para un SSDC basado en
algoritmos de IA para segmentación y clasificación de cáncer de colon.
En el contexto descrito, este trabajo de tesis diseñó Servicios de Soporte a la Decisión Clínica
(SeSDC), basados en los algoritmos de IA desarrollados para la plataforma DeepPathology. Se
consideraron como factores claves: (i) usabilidad, (ii) desarrollo colaborativo, y (iii)
integración orgánica en los flujos de trabajo, para habilitar un nuevo proceso que brinde
apoyo a la labor diagnóstica de los especialistas de AP e incremente el valor para los pacientes.
El desarrollo del trabajo consideró la elaboración de artefactos de software para la especificación
de los SeSDC. Mediante una encuesta se caracterizó a los usuarios patólogos/as y se evaluó el
valor que otorgaban a cuatro servicios. Utilizando notación BPMN (Business Process Model
Notation) se modeló el actual proceso diagnóstico y se propuso la integración de los SeSDC en
el flujo de trabajo de un servicio de AP. Con base en la implementación de un prototipo se
evaluó el nivel de aceptación. Se tradujo y adaptó el marco de trabajo NASSS para evaluar
aquellos factores claves en una implementación.
Los resultados entregaron el diseño de los SeSDC basados en los modelos de IA desarrollados para la plataforma DeepPathology. Se generó un nuevo proceso diagnóstico mediante el
rediseño que integró los SeSDC en el flujo de trabajo de un servicio de AP. Los factores
propuestos como claves fueron evaluados como facilitadores, pero se detectaron otros factores
necesarios de considerar para habilitar una adopción exitosa de este nuevo proceso diagnóstico.
El presente trabajo aporta una propuesta de diseño de servicios en PD que aspira a entregar
directrices para la integración de IA en un flujo clínico. Contribuye a la evidencia empírica sobre
los desafíos para el uso de IA en SeSDC de AP. Se espera que esta propuesta pueda ser replicada
en otras especialidades médicas que enfrentan desafíos similares.
En conclusión, esta tesis aporta una metodología que establece cómo integrar IA en un flujo
clínico mediante SeSDC. identificando los principales factores a considerar para habilitar una
implementación exitosa del nuevo proceso diseñado para entregar apoyo a la labor diagnóstica
de los patólogos/as en beneficio de los pacientes. Cancer is one of the leading causes of mortality worldwide. It is the first in Chile and is expected
to increase by 60% in the next 20 years. Likewise, the number of Anatomic Pathology (AP)
examinations has increased resulting in an overload of work for pathologists. In addition, a
certain degree of variability in diagnosis has been evidenced. For example, in colon cancer,
interobserver variability is moderate (κ = 0.59), and intraobserver variability is lower (κ = 0.71)
but with a change in diagnosis between 3 to 30% of cases. Correct and timely diagnosis is critical
for patients initiating aggressive treatments. This raises the question: How do we support the
diagnostic labor of pathologists and improve their working conditions?
Digital Pathology (DP) is the study of virtual slides, which by incorporating Artificial
Intelligence (AI), acquires the potential to support the diagnostic work through the analysis of
digital biopsy images, implementing Clinical Decision Support Systems (CDSS). In particular,
during 2020-2021 the FONDEF ID19|10334 project DeepPathology generated a DP platform,
with components for a CDSS which implemented AI algorithms for segmentation and
classification of colon cancer.
In the described context, this thesis work designed Clinical Decision Support Services
(CDSSe) based on AI algorithms developed for the DeepPathology platform. Key factors
considered were: (i) usability, (ii) collaborative development, and (iii) organic integration
into workflows, to enable a new process to support the diagnostic work of AP specialists and
increase value for patients.
The development considered the elaboration of software artifacts for the specification of
CDSSe. A survey was carried out to characterize the pathologist users and to evaluate the value
they gave to four services. Using BPMN (Business Process Model Notation), the current
diagnostic process was modeled and the integration of CDSSe into the workflow of an AP
service was proposed. Based on the prototype's implementation, the acceptance level was
evaluated. The NASSS framework was translated and adapted to evaluate those key factors in
implementation.
The results delivered the design of CDSSe based on AI models developed for the
DeepPathology platform. A new diagnostic process was generated through the redesign that integrated CDSSe into the workflow of a AP service. The proposed key factors were evaluated
as facilitators, but other factors that needed to be considered were detected to enable successful
adoption of this new diagnostic process.
This work provides a proposal for service design in DP that aims to provide guidelines for the
integration of AI in a clinical flow. It contributes to the empirical evidence on the challenges for
the use of AI in CDSSe for AP. It is expected that this proposal can be replicated in other medical
specialties facing similar challenges.
In conclusion, this thesis provides a methodology that establishes how to integrate AI into a
clinical workflow through CDSSe, identifying the main factors to be considered to enable a
successful implementation of the new process designed to support the diagnostic work of
pathologists for the benefit of patients.
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Tesis para optar al grado de Magíster en Informática Médica
Patrocinador
FONDEF IDeA I+D 2019, DeepPathology ID19|10334; FONDECYT 1211988; FONDECYT 3220832; FONDEQUIP EQM210020
Identifier
URI: https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/200434
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