Estudio bioinformático sobre la evolución de la piocina S14 de Pseudomonas sp. I1 dentro del subgrupo Pseudomonas koreensis
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2022Metadata
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García, Victor Antonio
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Estudio bioinformático sobre la evolución de la piocina S14 de Pseudomonas sp. I1 dentro del subgrupo Pseudomonas koreensis
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El incremento de la resistencia contra los antibióticos por parte de bacterias patógenas
como Pseudomonas aeruginosa es un problema actual para el cual se deben buscar
estrategias alternativas al uso de antibióticos convencionales. Una de las alternativas es
el uso de antimicrobianos como las bacteriocinas, las bacteriocinas son proteínas con
actividad antimicrobiana específica, estas son sintetizadas por bacterias como
mecanismo de competencia contra otras bacterias filogenéticamente cercanas. Un tipo de
bacteriocina son las piocinas, estas son sintetizadas por bacterias del género
Pseudomonas. Se ha demostrado la capacidad antimicrobiana de diferentes piocinas y
conocer los mecanismos tras su rápida adaptación y evolución es un paso importante que
se debe dar para la creación de estrategias para el control de enfermedades causadas
por bacterias patógenas como P. aeruginosa. Hasta la fecha no hay estudios detallados
que aborden los mecanismos moleculares de la especificidad y la evolución de estas
piocinas. Esta investigación apunta a identificar el mecanismo de evolución de una
piocina nueva con presunta actividad DNAsa denominada piocina S14 previamente
identificada mediante minería genómica en el genoma de un aislado de Pseudomonas
capaz de inhibir el crecimiento de P. aeruginosa PAO1. Con esto se espera aportar al
posterior desarrollo de nuevas estrategias para el control de bacterias patógenas. Para
esta investigación se realizó un análisis evolutivo bioinformático del genoma de diferentes
cepas del subgrupo Pseudomonas koreensis y de las bacteriocinas encontradas en su
genoma, esto mediante la reconstrucción filogenética de muestras del subgrupo P.
koreensis y la Identificación y comparación filogenética y de motivos funcionales de
ortólogos de la piocina S14 presentes en los genomas de las cepas del subgrupo P.
koreensis. La investigación permitió identificar la organización filogenética de las cepas
en estudio y sus piocinas, además de las principales zonas variables dentro de la
secuencia de las proteínas. Permitiendo así identificar el mecanismo de evolución de estas piocinas como el desarrollo evolutivo de un ancestro común en las piocinas
ortólogas de la piocina S14, similar al mecanismo de las colicinas con actividad DNAsa.
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Tesis para optar al título profesional de Tecnólogo Médico con mención
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URI: https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/200815
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