Professor Advisor | dc.contributor.advisor | Rojas G., María Cecilia | es_CL |
Author | dc.contributor.author | Amaya Torres, María Isabel | es_CL |
Staff editor | dc.contributor.editor | Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas | es_CL |
Admission date | dc.date.accessioned | 2013-05-28T21:24:58Z | |
Available date | dc.date.available | 2013-05-28T21:24:58Z | |
Publication date | dc.date.issued | 2012-07 | |
Identifier | dc.identifier.uri | https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/113419 | |
General note | dc.description | Tesis presentada a la Universidad de Chile
para optar al grado académico de Magister en Bioquímica área de
especialización en Bioquímica Ambiental y
Memoria para optar al título profesional de Bioquímico | es_CL |
General note | dc.description | Memoria de título de bioquímico | es_CL |
General note | dc.description | No autorizada por el autor para ser publicada a texto completo | es_CL |
Abstract | dc.description.abstract | El hongo filamentoso Fusarium fujikuroi produce diversos metabolitos secundarios entre los
que se encuentran las giberelinas (GAs), diterpenoides tetracíclicos derivados del ácido
mevalónico de interés agronómico debido al efecto regulador que presentan sobre el crecimiento
y desarrollo de las plantas. El interés comercial de estas moléculas y la alta eficiencia del sistema
fúngico han llevado a caracterizar su biosíntesis a nivel de las reacciones químicas, las enzimas y
los genes implicados en el proceso. La secuencia biosintética consiste principalmente en
reacciones de oxidación, las que son catalizadas por monooxigenasas (MO) P450 codificadas
por genes agrupados en un cluster. En este hongo la biosíntesis de GAs se induce en condiciones
de carencia de compuestos nitrogenados y es inhibida por amonio o glutamina debido a la
represión de los genes. Este mecanismo de regulación está mediado principalmente por el
regulador global AREA, un factor de transcripción cuya actividad depende de los niveles de
nitrógeno, aunque también podrían participar otros elementos regulatorios específicos para esta
vía metabólica.
Con el objeto de contribuir a la comprensión de los mecanismos de regulación de la
biosíntesis de las GAs fúngicas, en este trabajo de Tesis se investigó si los genes de GAs de F.
fujikuroi se expresan como proteínas activas en tres especies de hongos filogenéticamente
relacionadas a F. fujikuroi: Fusarium oxysporum, Fusarium graminearum y Aspergillus
nidulans. Estos hongos no poseen los genes de la biosíntesis de GAs pero contienen el regulador
global AREA. Interesó determinar si la complementación con el cluster de genes de F. fujikuroi
es suficiente para generar la capacidad de biosintetizar GAs en estas especies y si las
transformantes presentan el mecanismo de represión por amonio. Se caracterizó la producción de
GAs en cultivos líquidos mediante cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas
(GC-MS) y las actividades de las distintas oxidasas de GAs se ensayaron mediante sustratos
marcados con [14C] e identificando los productos por cromatografía en capa fina y cromatografía
líquida de alta resolución.
Se encontró que las transformantes T6, T11 y T1 de F. oxysporum así como la transformante T2
de F. graminearum presentan la capacidad de biosintetizar GAs en un medio líquido carente de
compuestos nitrogenados. Principalmente sintetizan GAs 3β-hidroxiladas y 19-γ10-lactónicas (19C) como GA4, GA7 y GA3, además algunas GAs no hidroxiladas (GA9, GA24, GA25) y entkaurenoides,
que son productos laterales de la vía biosintética. Este patrón de productos
corresponde al que presenta la cepa silvestre IMI28589 de F. fujikuroi, sistema fúngico que
sintetiza GA3 como producto final a partir de intermediarios 3β-hidroxilados. Estos resultados
indican que los genes de la biosíntesis de GAs de F. fujikuroi se expresan y generan enzimas
activas tanto en F. oxysporum como en F. graminearum. En particular, la metabolización del
ácido ent-[14C]kaurenoico hasta [14C]GA14 y posteriormente hasta [14C]GA3 demostró que la MO
P450-1 (GA14 sintasa) presenta las actividades de 7-oxidasa y de 3β-hidroxilasa, como en F.
fujikuroi. Por otra parte, la MO P450-2 (GA20 oxidasa) forma el producto lactónico [14C]GA9 y
su derivado [14C]GA40, a partir del sustrato [14C]GA12. En estos ensayos también se detectaron
las actividades de 13-hidroxilasa y de desaturasa aunque con diferentes proporciones en las
distintas transformantes, en concordancia con el análisis de GAs endógenas.
El efecto represor del nitrato de amonio se determinó a través de la actividad de la GA20
oxidasa en la transformante de F. graminearum T2, donde se encontró que la velocidad de
utilización de [14C]GA12 fue 5 veces menor en un medio con nitrato de amonio 4,8 g/L que en un
medio sin amonio, en forma similar a la cepa silvestre IMI28589 de F. fujikuroi (siete veces
menor en presencia de amonio). Esto sugiere que estaría operativo en F. graminearum el
mecanismo de represión por compuestos nitrogenados. Para la transformante T6 de F.oxysporum
el resultado fue menos claro, ya que se obtuvieron productos en presencia de amonio que no
corresponden a la lactona [14C]GA9 o a su derivado [14C]GA40 (los principales productos de la
GA20 oxidasa). La identificación de los productos por GC-MS permitirá confirmar si
corresponden a la actividad de oxidasas inespecíficas y si la represión por nitrato de amonio está
presente en esta especie.
A diferencia de las transformantes de F. oxysporum y de F. graminearum, en cultivos de la
transformante de A. nidulans no se detectó actividad de ninguna de las oxidasas de GAs en los
ensayos con los sustratos marcados con [14C]. Esto sugiere que los genes de F. fujikuroi no se
expresarían en A. nidulans, una especie filogenéticamente más alejada de F. fujikuroi que F.
oxysporum y F. graminearum, a pesar de que AREA está presente en esta especie. En conclusión, los resultados obtenidos sugieren que las dos especies de Fusarium
investigadas, F. oxysporum y F. graminearum, contienen los elementos regulatorios (AREA y/u
otros) requeridos para la expresión de los genes de la biosíntesis de GAs en condiciones de
carencia de nitrógeno. Estos factores no serían específicos para esta vía, ya que se encontraron
en dos especies fúngicas que no contienen genes de la biosíntesis de GAs y no sintetizan estos
diterpenos. | es_CL |
Abstract | dc.description.abstract | The filamentous fungus Fusarium fujikuroi synthesizes several secondary metabolites
including gibberellins (GAs), tetracyclic diterpenoids derived from mevalonic acid that have an
agronomic interest since they are plant growth regulators. Because of the high efficiency of the
fungal system and its commercial interest GA biosynthesis has been characterized at the level of
chemical reactions, enzymes and genes. The fungal GA biosynthetic pathway is based on
oxidative reactions catalyzed by P450 monooxygenases (MO) codified by a gene cluster. GA
biosynthesis is induced in the absence of nitrogenated compounds and inhibited by ammonia or
glutamine due to repression of gene expression. The global regulator AREA, a transcription
factor dependent on nitrogen levels, mediates this effect, together with other possible specific
regulatory elements.
In order to contribute to the understanding of GA biosynthesis regulation in F. fujikuroi in
this work we investigated if the F. fujikuroi GA biosynthesis genes are expressed as active
enzymes in three fungal species phylogenetically related to F. fujikuroi: Fusarium oxysporum,
Fusarium graminearum and Aspergillus nidulans. These species do not contain the GA
biosynthesis genes but contain the global regulator AREA. It was investigated if
complementation with the F. fujikuroi gene cluster is enough to restore GA biosynthesis in these
fungal species and if the transformants present ammonium repression of the GA genes as in F.
fujikuroi. GA biosynthesis was determined in liquid cultures by gas chromatography coupled to
mass spectrometry (GC-MS) and the activities of GA oxidases were assayed with [14C]-labelled
substrates by identifying the respective products by thin layer chromatography or high
performance liquid chromatography.
F. oxysporum transformants T6, T11 and T1 as well as F. graminearum T2 synthesized GAs in
liquid cultures that do not contain nitrogenated compounds. These were mainly 19-γ10-lactonic,
3β-hydroxylated GAs (C19; GA4, GA7 and GA3) together with non-hydroxylated GAs (GA9,
GA24,GA25) and ent-kaurenoids, lateral products of the GA biosynthetic pathway. This product
pattern corresponds to that of the wild-type F. fujikuroi strain IMI28589 that synthesizes GA3 as
final product from 3β-hydroxylated intermediates. These results demonstrate that the F. fujikuroi
GA biosynthesis genes are expressed as active enzymes in F. oxysporum as well as in F. graminearum. Particularly the conversion of ent-[14C]kaurenoic acid into [14C]GA14 and further
into [14C]GA3 demonstrated that in F. oxysporum and F. graminearum GA14 synthase presents 7-
oxidase and 3β-hydroxylase activities as in F. fujikuroi. On the other hand, in these
transformants GA20 oxidase gave the 19-γ10-lactonic product [14C]GA9 or its derivative
[14C]GA40 from [14C]GA12. 13-hydroxylase and desaturase activities were also detected in these
assays even when in different proportions in the distinct transformants in agreement with
endogenous GA analysis.
Ammonium nitrate repressor effect was investigated over GA20 oxidase that was assayed in
F. graminearum T2 liquid cultures. The rate of [14C]GA12 conversion was found to be 5 times
less in 4,8 g/L ammonium-containing media than in the absence of ammonium, similar to that
found for F. fujikuroi IMI28589 cultures (7 times less [14C]GA12 conversion in media containing
ammonia). This suggests that the mechanism of repression by nitrogenated compounds would be
active in F. graminearum. For F. oxysporum T6 a less clear result was obtained since the
products formed in the presence of 4,8 g/L ammonium nitrate do not include [14C]GA9 or
[14C]GA40, the main products of GA20 oxidase. GC-MS identification of these products will
allow to confirm if they correspond to unspecific oxidation products and if ammonium
repression is also present in F. oxysporum.
In contrast to F. oxysporum and F. graminearum, the cultures of A. nidulans complemented
with the F. fujikuroi GA biosynthesis genes did not present activity of any of the GA oxidases in
assays with ent-[14C]kaurenoic acid, [14C]GA12 or [14C]GA4. This suggests that the F. fujikuroi
genes would not be expressed in A.nidulans, a species phylogenetically less related to F.
fujikuroi, even when it contains AREA.
Altogether, the results obtained suggest that the two Fusarium species investigated contain
the regulatory elements required for the expression of the GA biosynthesis genes (AREA and/or
others) in the absence of nitrogenated compounds. These factors would not be specific for the
GA pathway since they are present in two fungal species that do not contain the GA biosynthesis
genes and do not synthesize GAs. | en |
Patrocinador | dc.description.sponsorship | Fondecyt | es_CL |
Lenguage | dc.language.iso | es | es_CL |
Publisher | dc.publisher | Universidad de Chile | es_CL |
Keywords | dc.subject | Giberelinas | es_CL |
Keywords | dc.subject | Oxidasas | es_CL |
Keywords | dc.subject | Fusarium | es_CL |
Keywords | dc.subject | Aspergillus nidulans | es_CL |
Título | dc.title | Funcionalidad de las oxidasas de giberelinas de Fusarium fujikuroi en transformantes de Fusarium oxysporum, Fusarium graminearum y Aspergillus nidulans | es_CL |
Document type | dc.type | Tesis | |