Professor Advisor | dc.contributor.advisor | Acuña Patzke, Mónica | |
Author | dc.contributor.author | Alvarez Rivera, Eduardo Rafael | |
Admission date | dc.date.accessioned | 2021-07-15T20:38:14Z | |
Available date | dc.date.available | 2021-07-15T20:38:14Z | |
Publication date | dc.date.issued | 2013 | |
Identifier | dc.identifier.uri | https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/180623 | |
General note | dc.description | Tesis para optar al grado de Magíster en Ciencias Biológicas Mención Genética. | es_ES |
Abstract | dc.description.abstract | Introducción: El cáncer es la segunda causa de muerte en Chile, y el digestivo es
responsable del 46,2% del total de los fallecimientos por esa causa; de ellos, el
cáncer colorrectal (CCR) es la tercera causa de muerte después del gástrico y biliar.
Entre los fármacos más empleados para el tratamiento del CCR se encuentran los
análogos de las pirimidinas (5-FU y su pro droga Capecitabina), que tienen como
blanco de acción a la enzima Timidilato Sintasa (TS), que cumple un rol clave en la
síntesis de DNA. La respuesta a este tratamiento no es igual para todos los
individuos, se ha postulado que la resistencia farmacológica en algunos pacientes, se
debería a la presencia de variantes genéticas en la región enhancer del gen TS, que
producirían modificaciones cuantitativas y/o cualitativas de la enzima TS.La
farmacogenética ha logrado avances en la búsqueda de marcadores biológicos que
están permitiendo predecir la respuesta interindividual a las terapias farmacológicas.
Los estudios clínicos realizados en pacientes con CCR sugieren que el locus TSER
(Thymidilate Synthase Enhancer Region)sería un buen indicador de la respuesta al
tratamiento a los análogos de la pirimidinas. En todas las poblaciones estudiadas, se
ha descrito, la presencia de dos polimorfismos en el locus TSER, el primero consiste
en un VNTR (variable number tandem repeats), de 28 pares de bases (pb) que
origina los alelos TSER*2 y TSER*3, y el segundo en un SNP (single nucleotide
polymorphism), que produce unasustitución nucleotídica G>C, dentro de la segunda
repetición del alelo TSER*3. Ambos afectarían la expresión de la proteína TS. Objetivo:Discernir larelación entre las variantes genotípicas del locus TSER y la
expresión de la proteína TS en tejido normal y tumoral en pacientes chilenos con
cáncer de colon y/o recto.
Pacientes y muestras: En el presente estudio participaron 53 pacientes con
CCR, atendidos en el Hospital San Juan de Dios-Santiago de Chile, de las biopsias
fijadas en formalina e incluidas en parafina se obtuvo muestras de tejido normal y
tumoral.
Métodos: Se genotipificaron las muestras de los distintos individuos de acuerdo a
los dos polimorfismos descritos para el locus TSER. Se emplearon las técnicas de
PCR para las dobles y triples repeticiones en tándem de 28pb y RFLP para la
sustitución G>C, ubicada en la segunda repetición del alelo TSER*3. Mientras que la
expresión intratumoral de la proteína TS fue evaluada por inmunohistoquímica (IHQ)
en tejido fijado e incluido en parafina.
Resultados: Las frecuencias genotípicas para el locus TSER según VNTR y SNP
(G>C) en tejido normal fueron las siguientes: TSER*2/*2 (22,6%), TSER*2/*3C
(15,1%), TSER*2/*3G (35,9%), TSER*3C/*3C (3,8%), TSER*3G/*3C (15,1%),
TSER*3G/*3G (7,6%). Se observó pérdida de heterocigocidad en tejido tumoral en
individuos con genotipo TSER*2/*3C (3,8%) y TSER*2/*3G (11,4%), generando los
genotipos TSER*2/-- (5,7%), TSER*3C/-- (1,9%) y TSER*3G/-- (7,6%). Se encontró asociación estadísticamente significativa (P< 0.05) entre las variantes genotípicas
del locus TSER y la expresión de proteína TS en tejido normal y tumoral.
Conclusiones: Hemos encontrado que la mayor expresión de la proteína se
asocia fuertemente con la presencia de los genotipos que tienen al menos un alelo
TSER*3G. Por lo tanto la genotipificación en tejido normal y tumoral de los
polimorfismos ya descritos, podrían servir como potenciales predictores de la eficacia
de los tratamientos con 5-FU en pacientes chilenos con diferentes tipos de cánceres.
Se requieren más estudios para clarificar el verdadero rol que estarían jugando estos
polimorfismos en el tratamiento con 5-FU en nuestra población. | es_ES |
Abstract | dc.description.abstract | Introduction: Cancer is the second leading cause of death in Chile, and the tract is
responsible for 46.2% of total deaths for that cause, of which colorectal cancer (CRC)
is the third leading cause of death after gastric and bile. Among the most commonly
used drugs for the treatment of CRC are pyrimidine analogs (5-FU and its pro-drug
Capecitabine), which target the enzyme action Thymidylate Synthase (TS), which
plays a key role in the DNA synthesis. The response to this treatment is not the same
for all individuals, it has been postulated that the drug resistance in some patients, be
due to the presence of genetic variants in the region TS gene enhancer, which
produce modifications quantitative and/or qualitative of TS
enzyme.Pharmacogenetics has made progress in the search for biomarkers that
predict response are allowing interindividual to pharmacological therapies.
Clinical studies in patients with CRC suggest that TSER locus (Thymidylate Synthase
Enhancer Region) would be a good indicator of treatment response to pyrimidine
analogs. In all populations studied, has been described, the presence of two
polymorphisms in the TSER locus, the first is a VNTR (variable number tandem
repeats) of 28 base pairs (bp) that originates TSER*2 allele and TSER*3, and the
second in a SNP (single nucleotide polymorphism), which produces a nucleotide
substitution G>C, in the second repeat of TSER*3 allele. Both affect the TS protein
expression. Objective: To discern the relationship between the genotypic variants of locus
TSER and TS protein expression in normal and tumor tissue in Chilean patients with
colon and/or rectum.
Patients and samples: The present study included 53 patients with CRC treated
at the Hospital San Juan de Dios, Santiago, Chile, from biopsies fixed in formalin and
embedded in paraffin samples obtained normal and tumor tissue.
Methods: We genotyped samples from different individuals according to the two
polymorphisms described for TSER locus. We used PCR techniques for double and
triple tandem repeats of 28pb and RFLP for substitution G>C, located in the second
repeat of TSER*3 allele. While the intratumoral expression of TS protein was
evaluated by immunohistochemistry (IHC) on tissue fixed and embedded in paraffin.
Results: The genotype frequencies for TSER according VNTR locus SNP (G>C) in
normal tissue were: TSER*2/*2 (22.6%), TSER*2/*3C (15.1%), TSER*2/*3G (35.9%),
TSER*3C/*3C (3.8%), TSER*3G/*3C (15.1%), TSER*3G/*3G (7.6%). Loss of
heterozygosity (LOH) was observed in tumor tissue in individuals with genotype
TSER*2/*3C (3.8%) and TSER*2*/3G (11.4%), generating genotype TSER*2/--
(5.7%), TSER*3C/-- (1.9%) and TSER*3G/-- (7.6%). Statistically significant
association was found (P<0.05) between a locus TSER genotype and TS protein
expression in normal and tumor tissue. Conclusions: Were found that the enhanced expression of the protein is strongly
associated with the presence of the genotypes that have at least one allele TSER*3G.
Therefore genotyping in normal and tumor tissue of the polymorphisms described
above, could serve as potential predictors of efficacy of treatment with 5-FU in
Chilean patients with different cancers. Further studies are needed to clarify the true
role they would play these polymorphisms on treatment with 5-FU in our population. | es_ES |
Publisher | dc.publisher | Universidad de Chile | es_ES |
Type of license | dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Chile | * |
Link to License | dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/cl/ | * |
Keywords | dc.subject | Neoplasias del colon - Genética | es_ES |
Keywords | dc.subject | Timidilato sintasa - Genética | es_ES |
Keywords | dc.subject | Genotipo | es_ES |
Keywords | dc.subject | Elementos de facilitación genéticos - Genética | es_ES |
Keywords | dc.subject | Regiones promotoras genéticas - Genética | es_ES |
Título | dc.title | Asociación entre las variantes de la región enhancer de la Timidilato Sintasa (TSER) y expresión de la proteína Timidilato Sintasa (TS) en pacientes chilenos con cáncer colorrectal | es_ES |
Document type | dc.type | Tesis | es_ES |
Cataloguer | uchile.catalogador | prv | es_ES |
Department | uchile.departamento | Escuela de Postgrado | es_ES |
Faculty | uchile.facultad | Facultad de Medicina | es_ES |