Determinación del estado mutacional de genes de relevancia oncológica en tumores de pacientes chilenos con Cáncer de Vesícula Biliar

Abstract

El cáncer de vesícula biliar (CVB) es un cáncer agresivo y de mal prognóstico, que requiere la implementación de nuevas estrategias terapéuticas. En Chile, su incidencia y mortalidad son de las más altas registradas globalmente. Este estudio busca identificar la presencia de mutaciones somáticas en CVB descritas como predictoras de respuesta a terapias en otros tipos tumorales, y evaluar potenciales diferencias regionales, contrastando las mutaciones detectadas para pacientes de Chile con cohortes de poblaciones de Japón, China, Singapur, y EEUU. Así, a través de la secuenciación NGS de un panel de 25 genes biomarcadores de respuesta a terapia en 34 pacientes de CVB, se identificaron 26 pacientes (76%) con al menos una mutación somática exónica. Los genes mutados de mayor frecuencia incluyen a TP53 (47%), KRAS (15%), y ARID1A (12%). Si bien no se detectaron diferencias significativas al momento de comparar frecuencia mutacional entre cohortes de Japón, China, Singapur, y EEUU, se registraron distintas mutaciones puntuales entre grupos contrastados. Los resultados obtenidos podrían reflejar una fracción del perfil de mutaciones de tumores de CVB en pacientes de Chile, generando información relevante para la caracterización molecular de este tipo de cáncer, y futuras opciones de terapias a nivel nacional.

Gallbladder Cancer (GBC) is a rare, aggressive malignancy of the biliary tract associated with a poor prognosis, underlining the necessity of new therapeutic strategies. In Chile, the incidence and mortality of GBC are among the highest worldwide. This study aims to identify the presence of somatic actionable alterations that could potentially guide future treatment options, and to evaluate the effect of a regional context upon particular somatic mutations present in GBC tumors, contrasting the mutations detected for patients from Chile against cohorts of populations from Japan, China, Singapore, and the USA. NGS target capture-based deep sequencing was performed for a panel of 25 actionable genes. Overall, the most frequently mutated genes include TP53 (47%), KRAS (15%), and ARID1A (12%), with 26 out of 34 patients (76%) having at least one somatic mutation in exonic regions. Although mutation frequency did not appear to significantly differ among the cohorts, discrepancies were observed in the mutations identified. Altogether, our results represent a first approach aiming to identify the mutational profile of GBC in Chilean patients, providing relevant information that may contribute to the molecular characterization of GBC and to guide the implementation of future therapy options in Chile.