Fisuras orofaciales en Chile : asociación entre niveles de metilación global del ADN y variantes genéticas presentes MTHFR, SLC19A1 Y TCN2
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2020Metadata
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Suazo Sanhueza, José Lorenzo
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Fisuras orofaciales en Chile : asociación entre niveles de metilación global del ADN y variantes genéticas presentes MTHFR, SLC19A1 Y TCN2
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En la etiología de las fisuras orofaciales no sindrómicas (FOFNS) el metabolismo de los folatos
jugaría un importante rol, en donde se han reportado asociaciones con variantes
hipofuncionales de genes de este metabolismo sumado a que el bajo consumo materno de
esos micronutrientes es uno de los factores ambientales más importantes. Esta vitamina es
crucial para la síntesis y metilación del ADN. En Chile, a pesar del aumento del consumo de
folatos, no ha disminuido la tasa de FOFs. En el presente estudio se evaluó el riesgo de FOFNS
en Chile asociado a niveles bajos de metilación global del ADN. Para ello se evaluaron 95
casos y 95 controles pareados por sexo y edad donde se cuantificó mediante
pirosecuenciación los niveles de metilación de LINE-1 (marcador de metilación global del ADN)
en células de la mucosa oral. Además, se evaluó la asociación de los niveles de metilación de
LINE-1 con las variantes de los genes del metabolismo del folato MTHFR, SLC19A1 y TCN2.
Los resultados muestran un aumento del riesgo de FOFNS asociado a hipometilación del ADN
(p=0.008), pero este riesgo no se ve modificado por el genotipo de ninguna de las variantes
de los tres genes analizados. En conclusión, nuestros hallazgos confirman la hipótesis sobre
el aumento de la susceptibilidad a FOFNS cuando el DNA esta poco metilado, lo que podría
afectar la expresión génica. Los resultados de interacción gen-metilación pueden ser efecto
del modesto tamaño muestral utilizado. In the etiology of non-syndromic orofacial clefts (NSOFC) the metabolism of folates would play
an important role, where associations with hypofunctional variants of genes involved in this
metabolism have been reported in addition to the low maternal intake of these micronutrients
is one of the most important environmental factors. This vitamin is crucial for the synthesis and
methylation of DNA. In Chile, despite the increase in folate consumption, the OFC rate has not
decreased. In this study, we assessed if the risk of NSOFC in Chile was associated with low
levels of global DNA methylation. For this purpose, 95 cases and 95 controls matched by sex
and age were evaluated, where the methylation levels of LINE-1 (global DNA methylation
marker) in oral mucosa cells were quantified by pyrosequencing. In addition, the role of variants
of the folate metabolism genes MTHFR, SLC19A1 and TCN2 on the association between these
variables was evaluated. The results indicate an increase of the risk of NSOFC associated with
DNA hypomethylation (p = 0.008), but this risk is not modified by the genotype of any of the
variants in the three genes considered. In conclusion, our findings confirm the hypothesis about
the increased susceptibility to NSOFC when the DNA is poorly methylated, which could affect
gene expression. The results of gene-methylation interaction may be the effect of the modest
sample size considered.
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Tesis para optar al grado de Magíster en Genética
Identifier
URI: https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/184604
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