Mecanismo de inmunidad, de translocación y de conversión tipo prion de la microcina E492.
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2003Metadata
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Lagos Monaco, Rosa Alba Lucia
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Mecanismo de inmunidad, de translocación y de conversión tipo prion de la microcina E492.
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La microcina E492 (MccE492) es un polipéptido antibiótico que presenta
actividad bactericida sobre cepas de la familia Enterobactereaceae mediante la
formación de canales iónicos en la membrana citoplasmática. Los determinantes
genéticos necesarios para su producción, presentes en el genoma de Klebsiella
pneumoniae RCY492, se clonaron y expresaron en Escherichia coli, obteniéndose
una microcina recombinante con propiedades bioquímicas y biológicas idénticas a
la producida por Klebsiella. Mediante mutagénesis con Tn5 se determinó la
existencia de al menos 8 genes, además del gen estructural, involucrados en
procesos de maduración, procesamiento y exportación de la microcina.
La MccE492 es secretada en forma activa (Mcca
) durante la fase
exponencial de crecimiento, e inactiva (Mccia) durante la fase estacionaria,
fenómeno asociado a la falta de expresión de los genes mceI y J durante esta
última fase. Mutantes por transposición en los genes mceC, I y J sólo producen
Mccia en forma independiente de la fase de crecimiento, indicando que la
producción de Mccia es causada por la falta de un proceso de maduración a cargo
de los productos de estos genes. Este proceso de maduración no implica
modificaciones postraduccionales de la MccE492, ya que ambas formas de la
microcina presentan la misma masa molecular, con un valor que es idéntico al
valor esperado a partir de la secuencia del gen estructural. Se determinó que la
diferencia funcional entre ambas formas de la microcina no se debe a diferencias
en su estructura primaria, sino a diferencias en el contenido de estructura secundaria. La Mccia presenta una mezcla de hélice-
tanto que Mcca
presenta un alto contenido de hoja-. La Mccia mantiene la
capacidad para formar canales iónicos en la membrana citoplasmática, lo cual fue
demostrado en experimentos in vitro con bicapas fosfolipídicas e in vivo mediante
esferoplastos, los cuales son sensibles a la Mccia. Estos experimentos además
demuestran que la Mccia es incapaz de atravesar la membrana externa de la
célula blanco. Por otro lado, ensayos de competencia entre ambas formas de la
microcina muestran que la actividad de Mcca
no es inhibida por Mccia en
concentraciones saturantes (100 veces mayor). Este resultado sugiere que Mccia
falla en el reconocimiento de un receptor, ya que si ésta quedara “atrapada”
durante la translocación hacia el periplasma, bloquearía la vía de entrada de Mcca
e inhibiría su actividad bactericida. Por lo tanto, el proceso de maduración le
confiere a la MccE492 la conformación/oligomerización correcta para que pueda
reconocer/interaccionar con un receptor en la membrana externa de la célula
blanco.
La existencia de dos formas funcionales de la MccE492 con idéntica
estructura primaria pero con diferente conformación, asemejan a la MccE492 con
el fenómeno que se ha descrito para priones. Un prión se define como una
proteína con características infecciosas, que puede inducir un cambio desde una
estructura normal a una infecciosa. Al igual como sucede en priones, la Mcca
(mayor contenido de estructura hoja-) posee la capacidad de convertir a la forma
inactiva hacia la forma activa, como se demostró en ensayos de activación
diseñados para tal efecto, en los cuales se observó una ganancia en la actividad que va desde 2 a 27 veces. Esta ganancia de actividad fue acompañada por un
incremento en el contenido de conformación hoja-, determinado mediante
dicroismo circular en el UV-lejano. Estas conversiones se alcanzaron utilizando
muestras de microcina altamente puras, y el fenómeno de activación fue
propagado a través de ciclos de activación. Este resultado sugiere fuertemente
que la información conformacional se transmite de proteína a proteína siendo
menos probable la necesidad de algún otro factor. Un segmento de la MccE492
(residuos 16-38) presenta homología con la región conservada PrP (106-126) de
los priones de mamíferos, responsable de la conversión conformacional. En
ensayos de conversión in vivo, la cepa mutante np220 productora de MccE492(1-
43), fue capaz de activar a Mccia lo que se observó como un halo de inhibición de
crecimiento cuando ambas cepas son sembradas juntas sobre un césped de
células sensibles, fenómeno que no se observa cuando ambas cepas son
sembradas por separado. Estos resultados sugieren fuertemente que ésta región
es la que le confiere el comportamiento priónico a la microcina E492.
La proteína integral de membrana MceB confiere inmunidad a la MccE492,
en un mecanismo altamente eficiente y específico. El mecanismo más probable
para su acción incluye una interacción con TonB, proteína esencial en la acción de
la microcina. TonB sería necesaria para la inserción de la microcina en la
membrana citoplasmática, ya que esferoplastos TonB no presentan sensibilidad a
Mcca
ni a Mccia. Se utilizó una aproximación genética de compensación de
mutantes puntuales, para estudiar la existencia de una interacción entre MceB y
TonB. Mediante mutagénesis química del gen mceB se aislaron las mutantes puntuales MceBA17V y MceBA77V asociadas con una pérdida de la inmunidad,
cambios ubicados en la primera y tercera hélice de transmembrana
respectivamente, de acuerdo al modelo topológico de MceB. Este modelo es
apoyado por fusiones obtenidas entre MceB y la proteína PhoA, ya que sólo las
fusiones que ocurrieron en la vuelta periplasmática de MceB presentaron actividad
PhoA, contrario a lo observado en fusiones en hélices de transmembrana. Los
cambios obtenidos en MceB son conservados y afectarían la interacción
específica de MceB con TonB a través de sus hélices de transmembrana, como
consecuencia de un cambio en el empacamiento de la hélice, hecho que se ha
demostrado disminuye la constante de unión entre hélices de transmembrana.
Esto se demostró en experimentos de mutagénesis en los que se encontró
mutantes de TonB con la capacidad de compensar el fenotipo imm de mutantes
en MceB. Estas correspondieron a 3 tipos: las mutantes truncas TonB43-239 y
TonB109-239, y la mutante puntual TonBS16L localizada en la hélice de
transmembrana de la proteína, mutantes de TonB que no cumplen su función
biológica normal. TonB se encuentra en permanente transición entre isómeros
energéticos, propiedad que depende de su interacción con receptores de
membrana externa a través del extremo carboxilo terminal y con la proteína ExbB
a través de la hélice de transmembrana. Las mutantes de TonB pierden esta
capacidad, lo que aumentaría la disponibilidad de TonB para interaccionar con
MceB. De este modo se compensa la disminución en la afinidad entre ambas
proteínas que provocan las mutaciones puntuales en MceB. No obstante, las
células que portan las mutantes truncas de TonB presentaron sensibilidad a la MccE492. Estos resultados nos permiten concluir que sólo la región N-terminal de
TonB interactúa con MceB y, además, que sólo ésta región es necesaria para a la
acción de MccE492. Por lo tanto, la proteína TonB estaría implicada en la
inserción de la MccE492 en la membrana interna, y no en la translocación de
través de la membrana externa, a través del dominio periplasmático, como se ha
descrito para otros procesos TonB-dependientes, incluida la acción de colicinas
formadoras de poros. Lo anterior es apoyado por la resistencia a la microcina que
presentan los esferoplastos TonB y mediante ensayos con el pentapéptido
sintético caja-TonB, el cual no posee un efecto inhibitorio sobre la actividad de la
MccE492, como se ha descrito para la importación de moléculas que requieren de
la proteína TonB para su translocación a través de la membrana externa. Microcin E492 (MccE492) is an antibiotic polypeptide active on strains of the
family Enterobacteraceae. Its mechanism of action is through ion channels
formation into the inner membrane of the target cell. The genetic determinants
necessary for the production of active microcin are located in the chromosome of
Klebsiella pneumoniae RCY492. These were cloned and expressed in E. coli and
the recombinant microcin obtained had identical biochemical and biological
properties compared with the native microcin. The existence of eight accessory
genes necessary for the production of active microcin was determined through
random Tn5 mutagenesis. These genes are involved in maturation, processing and
export of microcin E492.
MccE92 is secreted in an active (Mcca
) and inactive (Mccia) form in the
exponential and stationary phase of growth, respectively. This phenomenon
correlated with the lack of transcription of mceI and J genes in the stationary
phase. Mutations in mceC, I and J genes result in the production of Mccia at any
growth phase, indicating that the production of Mccia is caused by the lack of a
maturation process. This process does not imply posttranslational modifications of
MccE492 because both forms, active and inactive, present the same molecular
mass, with a value that is identical to the expected value deduced from the gen
sequence. The functional difference between both microcin forms is not due to a
difference in the primary structure, but to a difference in secondary structure. Mccia
presents a high content of -helix structure, while Mcca
has a high content of -
sheet structure. Mccia is able to form ion channels in phospholipidic bilayers, although with differences in conductance when compared with Mcca
. On the other
hand, Mccia has a lethal effect when incubated with spheroplasts of sensitive cells,
indicating that the inactive microcin is not able to cross the outer membrane of the
target cell. In addition, the activity of Mcca
is not inhibited by high concentrations of
Mccia (100-fold over Mcca
concentration), indicating that the defect of Mccia is at the
level of receptor recognition, because a defect in the translocation process should
result in a blockade of the entryway of Mcca
, reducing its lethal effect. Therefore, it
is possible to conclude that the maturation process confers MccE492 the correct
conformation/oligomerization necessary in the recognition/interaction with the
receptor in the outer membrane of the target cell.
The existence of two functional forms of MccE492 with identical primary
structures but with differences in their conformation resembles the phenomenon
that has been described for prions. A prion is a protein with infectious properties
that induces a change from a normal protein to an infectious one. As happens in
prions, Mcca
(high -sheet content) possesses the ability to convert the inactive
form into the active form, as was shown in activation assays performed in different
solvents, in which an increase of activity of 2 - 27 fold was observed. This increase
in the activity was accompanied by an increase in the -sheet conformation,
determined by far-UV circular dichroism. These conversions were performed with
highly purified microcin samples and the activation phenomenon was propagated
in cycles of activation. These results strongly suggest that the conformational
information is propagated from protein to protein and the need of another factor is
less probable. A segment of the MccE492 (residues 16-38) is homologous to the conserved region PrP (106-126) of mammalian prions, a region responsible for the
conformational conversion process. A growth inhibition halo was observed when
the mutants np220 (MccE492(1-43)) an inactive truncated microcin) and np133
(Mccia, a maturation mutant in mceC) were seeded together onto a sensitive cell
lawn. This phenomenon was not observed when both strains were seeded
separately, indicating that Mccia was activated by MccE492(1-43). These results
strongly suggest that this region confers the prion-like properties to MccE492.
The integral membrane protein MceB confers immunity to MccE492, in a
specific and highly efficient mechanism. The most probable mechanism includes
an interaction with TonB, a protein that is essential for the microcin action. TonB is
necessary for the insertion of microcin into the cytoplasmic membrane, because
TonB spheroplasts are not sensitive to Mcca
or to Mccia. To study the existence of
an interaction between MceB and TonB, genetic experiments involving
compensation of point mutations were performed. After chemical mutagenesis of
the mceB gene, the point mutations MceBA17V and MceBA77V associated with
the loss of immunity were isolated. Both mutants presented conserved changes,
which are located in transmembrane helices according to a topological model of
MceB. Fusions obtained between MceB and PhoA protein were consistent whit this
model, because fusions that occurred in the periplasmic loop of MceB presented
PhoA activity, in contrast whit the lack of activity found in the fusions that occurred
in transmembrane-helices. The point mutations in MceB would modify the helix
packing value, an important parameter in the interaction between transmembrane
helices. In this way, point mutations in MceB would diminish the binding constant
between this protein and TonB through their transmembrane segments. This was confirmed by compensatory mutations in TonB. Three kinds of TonB mutants with
the ability to compensate the imm phenotype of the MceB point mutants were
isolated: truncated TonB43-239 and TonB109-239 mutants, and the TonBS16
point mutant. These mutants do not carry out the normal biological function of
TonB. This protein is in a permanent transition between energetic isomers,
property that depends on its interaction with the outer membrane receptors through
the C-terminal region and with the ExbB protein through the transmembrane helix.
The lack of isomerization process of TonB mutants would increase its availability to
interact with MceB and in this way would compensate the decrease in the affinity
between both proteins due to the point mutations in MceB. Truncated TonB
proteins are sensitive to MccE492 action, indicating that only the N-terminal region
of TonB is necessary for microcin action, probably for the insertion of MccE492 into
the cytoplasmic membrane. TonB would not be involved in the translocation of
microcin across the outer membrane, as it has been described for other TonB dependent processes such as the action of pore-forming colicins, because the
TonB mutants lack the C-terminal domain responsible for the interaction with the
receptors. This is further confirmed by the lack of inhibition of microcin activity by
the pentapeptide corresponding to a synthetic TonB-box. In similar conditions, this
peptide produces the inhibition of the import of molecules that requires the TonB
protein for them translocation across the outer membrane.
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Tesis entregada para optar al grado de Doctor en Microbiología.
Patrocinador
Financiamiento
proporcionado por el Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico
(FONDECYT), proyectos 1991017 y 1020757 (a la Dra. Rosalba Lagos), y
proyecto 1990028 ( a Marcelo Baeza).
Beca de postgrado entre los
años 1999 y 2000, y una beca de término de tesis en el año 2002 otorgadas
por la comisión Nacional de Investigación y Tecnología (CONICYT).
Identifier
URI: https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/185512
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