Caracterización del complejo binario [SdiA/AHL] en la transcripción del operón ftsQAZ . ¿Una relación entre quorum sensing y división celular?
Professor Advisor
dc.contributor.advisor
Monasterio Opazo, Octavio Hernán
Author
dc.contributor.author
Gallardo Nelson, María José
Admission date
dc.date.accessioned
2022-11-09T13:02:32Z
Available date
dc.date.available
2022-11-09T13:02:32Z
Publication date
dc.date.issued
2011
Identifier
dc.identifier.uri
https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/189064
Abstract
dc.description.abstract
El mecanismo de comunicación en bacterias se conoce como "Quorum
Sensing" (QS). Mediante este mecanismo de comunicación celular se regulan
procesos fundamentales de la fisiología bacteriana. En la bacteria Gram-negativa Escheichia coli se identificó una proteína homóloga a los reguladores
transcripcionales de tipo R pero no se encontraron moléculas de acil
homoserina lactonas (AHLs) en los cultivos. Este regulador transcripcional,
denominado SdiA, se asoció a la transcripción del operón fsQAZ. Este
transcrito da origen a las proteínas que forman parte de la maquinaria de
división celular. Se postula que existe una relación entre QS y división celular,
pero aún no se ha determinado el efecto que poseen las AHLs sobre la
transcripción de estos genes y sobre el mecanismo de división celular.
Se investigó el sistema de QS en E coli específicamente el efecto de la unión
de AHL a la proteína SdiA con el objeto de definir el mecanismo de unión del
ligando a la proteína y de esta al DNA de modo de explicar el porque no se
observan efectos en la división de la bacteria.
Se analizó el efecto de AHLs sobre la solubilidad de la proteína sobre-expresada. Se observó un aumento en la solubilidad de la proteína, pues
incrementó la proteína en la fracción soluble. Para explicar como las AHLs
influyen en la unión de SdiA a DNA, y determinar si la transcripción es mediada
o facilitada por AHLs se caracterizó el efecto de AHL sobre la dimerización de la
proteína. La inducción de un cambio conformacional asociado a la unión del
ligando y su posterior dimerización se evaluó midiendo la unión de AHL a la
proteína SdiA, a través de apagamiento de fluorescencia. Los resultados
muestran una afinidad en el rango nM, indicando que el apagamiento de la
fluorescencia es debido a un cambio conformacional inducido por la unión de
AHL que está probablemente asociado a la dimerización y a un cambio en el
porcentaje de estructura secundaria. Por esta razón se evaluó el efecto de AHL
sobre la estructura cuaternaria de la proteína y se determinó que la proteína en
ausencia de AHL se encuentra principalmente como monómero y en presencia
de AHL se inducen principalmente dímeros. Para identificar las regiones donde
ocurre este cambio conformacional inducido por la dimerización en presencia
del ligando, se hizo una cinética de intercambio isotópico. Se observó una
significativa protección al intercambio tanto en el dominio N-terminal como en el
dominio de unión a DNA.
Se observó una alta afinidad de unión, en el rango nM, de la proteína a la
secuencia promotora ftsQP2, resultado que se confirmó mediante la
visualización del complejo proteína-DNA a través de microscopía de fuerza
atómica. No hubo efecto de AHL sobre la unión de SdiA al DNA. Para evaluar el
efecto del sistema descrito sobre la transcripción del operón trsQAZ se midió su
expresión con el gen lacZ. Se observó un incremento en la transcripción cuando
la proteína se sobre-expresaba en una cepa mutante para SdiA. Los resultados
sugieren que la unión de AHL a SdiA induce la dimerización de SdiA, que como
dímero activo se une a la región promotora ftsQP2 en el DNA
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Lenguage
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Publisher
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Universidad de Chile
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