Validación de SNPS para el desarrollo de estrategias de estudios de asociación genómica, en salmones

Abstract

El salmón del Atlántico (Salmo salár constituye uno de los productos de exportación más importantes parachile y Noruega, por lo que su estudio y mejoramiento es crucial para el desarrollo de ambas economías. Esto puede ser llevado a cabo mediante herramientas moleculares, tales como marcadores genéticos (SNps), que han demostrado su efectividad en la selección genómica asistida para el mejoramiento de otras especies (Closter, Elferink, et al.. 2010). Este tipo de análisis requiere de un conjunto de SNPsde alta densidad donde cada loci del genoma se encuentre en desequilibrio de ligamiento con a Io menos uno de estos(Hayes and Goddard,20iO), haciendo esencial la correcta caracterización y clasificación de cada marcador presente en el genoma. Las múltiples duplicaciones del genoma del salmón (S0% de las secuencias codificantes) (Davey et al.,2OA1a, Utter et al., 1973),hacen necesaria la exclusión de las abundantes estructuras polimórficas presentes en regiones parálogas de su genoma (PSVS), y la caracterización de SNPS presentes en estas zonas (MSvs) para la elección de aquellos polimorfismos con alta conservación (Hardy-Weinberg principle), que constituyan marcadores eficientes para la selección genómica. Hasta el momento no existen acercamientos para resolver esta problemática a prior¡ significando altos costos y tiempos asociados a Ia clasificación, la cual no siempre es efectiva.Es por esto que proponemos lograr esto mediante la clasifjcación de los pol¡morfismos de múltiples individuos (MlVs) de acuerdo alos niveles de conservación de las regiones en las que se encuentran.