Aislamiento e identificación de hongos de suelo semiárido para la construcción de comunidades fúngicas experimentales

Abstract

Los hongos son organismos un¡celulares o multicelulares que cumplen roles claves en los ecosistemas, aportando con una alta diversidad de especies y participando en los ciclos biogeoquímicos. Ellos presentan variadas estrategias reproductivas, encontrando hongos que desarrollan ciclos de vida asexual. sexual, o que desarrollan el ciclo de vida completo. Históricamente, las estructuras microscópicas que participan en estos ciclos de reproducción han sido utilizadas como carácter taxonómico en la identificación de hongos. Además, el uso de marcadores moleculares, tales como los genes ribosomales, también han sido de gran ayuda en la identificación y clasificación taxonómica de las especies fúngicas. La primera parte de este trabajo se centró en el aislamiento e identificación de hongos desde un suelo semiárido del matorral esclerófilo de Chile central. Para esto se realizó un aislamiento de hongos desde muestras de suelo los cuales se caracterizaron inicialmente a nivel morfológico. La identificación taxonómica se complementó con un anáiisis molecular mediante el uso de los marcadores moleculares rDNA 18S, rDNA 28S, y la región intergénica iTS, en conjunto con la búsqueda por similitud de secuencia en base de datos. Ninguna de las herramientas de identificación, morfológica y molecular. permitió la identificación de la totalidad de los aislados (n=36), lo que refleja la necesidad de un análisis que involucre diferentes aproximaciones. Mediante la caracterización morfológica y molecular se as¡gnó Lrna identificación a los aislados, los que se agruparon en 3 divisiones, siendo la más abundante Ascomycota; en 15 familias, donde la más representada fue Trichocomaceae y en 21 géneros, siendo el más abundante Penicillium.

por otra parte, el desarrollo de nuevas herramientas que faciliten el estudio de la ecología microbiana ha sido un gran aporte para esta disciplina. Entre éstas. destaca la construcción de comunidades microbianas experimentales, que tienen como función reducir la complejidad asociada a los estudios de ecología microbiana. y permitir analizar sus componentes por separado. La elección de un modelo fúngico obedece a la importancia que estos organismos tienen en los ecosistemas. Por lo tanto. a partir de una fracción de los aislados fúngicos se construyó una comunidad experimental, como modelo para el estudio de interacciones biológicas. Para la construcción de la comunidad experimental, se eligieron 5 de los aislados fúngicos, los cuales se seleccionaron por pertenecer a los géneros de la familia fúngica más abundante según lo determinado mediante la aproximación dependiente de cultivo. Para poder evaluar la estructura de la comunidad, se utilizó la técnica del T-RFLP. la cual permitió identificar a los hongos constituyentes de ésta. Además, se evaluó el perfil metabólico de la comunidad experimental y los datos obtenidos se compararon con los perfiles metabólicos individuales de los hongos constituyentes, observándose diferencias entre ambos patrones metabólicos, lo cual da cuenta de la existencia de interacciones entre los hongos de la comunidad