Estudio fisicoquímico de B-carbolinas : aplicación a sistemas biológicos
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2004Metadata
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Cassels Niven, Bruce
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Estudio fisicoquímico de B-carbolinas : aplicación a sistemas biológicos
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El esqueleto β-carbolínico, 9-H-pirido[3,4-b]jindol, es la unidad básica de un grupo de
alcaloides indólicos, de variada actividad biológica. Los mecanismos de acción de β-carbolinas a nivel del sistema nervioso central o como agentes anticancerígenos se
conocen cada vez con mayor claridad. Sin embargo, respecto de las propiedades
quimioterapéuticas y de la actividad enzimática, la literatura sólo informa los resultados de
las pruebas de cribado, desconociéndose hasta el momento los modos de acción.
Esta tesis presenta un estudio fisico-químico de estos alcaloides, centrado en dos
áreas: el estudio de las propiedades electrónicas y de descriptores de reactividad químicа,
definidos en el marco conceptual de la Teoría de Funcionales de la Densidad, calculados a
nivel de teoría B3LYP/6-31G, y un estudio electroquímico, realizado a través de voltametría
cíclica lineal, en ambiente acuoso y a diferentes pH, y en un solvente aprótico (DMSO). Se
presenta además por primera vez la detección - por resonancia paramagnética electrónica
(EPR) y en presencia de un atrapador de radicales libres de una especie radicalaria
producto de la oxidación electroquímica de una tetrahidro-β -carbolina en ambiente
aprótico.
Puesto que la literatura informa que las β-carbolinas forman complejos de
transferencia de carga con flavinas (FAD, riboflavina), se estudió además, a través de los
descriptores de reactividad, la reacción de transferencia de hidruro entre las moléculas de
lumiflavina (7.8,10-trimetilisoaloxazina) y 1-metilnicotinamida como un modelo simplificado
del sistema FAD-NAD(P)H, presente en los procesos catalíticos de numerosas enzimas, el cual
podría ser intervenido por las β-carbolinas a través de una interacción FAD- β-carbolina.
Sobre la base de los resultados obtenidos se evaluó la correlación existente entre las
características físico-químicas y la actividad biológica que presentan una serie de
Sobre la base de los resultados obtenidos se evaluó la correlación existente entre las
características físico-químicas y la actividad biológica que presentan una serie de
Sobre la base de los resultados obtenidos se evaluó la correlación existente entre las
características fisico-químicas y la actividad biológica que presentan una serie de
β-carbolinas. Se midió entonces la actividad inhibitoria de las flavoenzimas MAO-A y MAO-В
de algunos de estos compuestos y la actividad tripanosomicida frente a dos cepas de
epimastigotes de Trypanosoma cruzi, Tulahuén y LQ, de susceptibilidades diferentes frente al
fármaco nifurtimox, utilizado clínicamente en el tratamiento de la enfermedad de Chagas.-carbolinas. Se midió entonces la actividad inhibitoria de las flavoenzimas MAO-A y MAO-В
de algunos de estos compuestos y la actividad tripanosomicida frente a dos cepas de
epimastigotes de Trypanosoma cruzi, Tulahuén y LQ, de susceptibilidades diferentes frente al
fármaco nifurtimox, utilizado clínicamente en el tratamiento de la enfermedad de Chagas.-carbolinas. Se midió entonces la actividad inhibitoria de las flavoenzimas MAO-A y MAO-В
de algunos de estos compuestos y la actividad tripanosomicida frente a dos cepas de
epimastigotes de Trypanosoma cruzi, Tulahuén y LQ, de susceptibilidades diferentes frente al
fármaco nifurtimox, utilizado clínicamente en el tratamiento de la enfermedad de Chagas.
Respecto de la reacción de transferencia de hidruro en el sistema lumiflavina-1-
metilnicotinamida, ésta se puede comprender como una interacción entre especies
blandas, controlada por los orbitales de frontera y bien enmarcada en el principio de ácidos
y bases duros y blandos de Pearson (HSAB). Descriptores globales como el potencial químico
electrónico, la electrofilia y la blandura describen apropiadamente la reactividad del sistema
estudíado. La regioespecificidad de la transferencia de hidruro estaría modulada por
propiedades de regiones extendidas dentro de la molécula, las que incluirían más de un
centro atómico. En este trabajo se encontró que los sitios reactivos de las moléculas que
participan en la interacción están ubicados en regiones de diferentes moléculas, con fomas
y tamaños similares y que presentan valores muy similares de blandura grupal, de acuerdo al
principio HSAB local.
Respecto de los descriptores de estructura electrónica de las B-carbolinas, se observa
que en el núcleo piridoindólico la dureza química y la blandura química dependen de la
aromaticidad del sistema, mientras que el potencial químico electrónico depende del grado
de insaturación de estos compuestos. La carga crítica, NMAX, y la electrofilia presentan una
tendencia menos clara ya que dependen tanto del potencial químico electrónico como de
la dureza química, observándose que las dihidro- Respecto de los descriptores de estructura electrónica de las B-carbolinas, se observa
que en el núcleo piridoindólico la dureza química y la blandura química dependen de la
aromaticidad del sistema, mientras que el potencial químico electrónico depende del grado
de insaturación de estos compuestos. La carga crítica, NMAX, y la electrofilia presentan una
tendencia menos clara ya que dependen tanto del potencial químico electrónico como de
la dureza química, observándose que las dihidro- β-carbolinas-carbolinas
son las más electrofilicas y las
que presentan mayor valor de NMAX, mientras que las tetrahidro- β-carbolinas son las menos electrofílicas y de menor NMAX. El análisis de los descriptores de reactividad en el sistema
lumitlavina- β-carbolina sugiere que estos alcaloides se comportan como dadores de
electrones frente a la molécula de lumiflavina, y tendrían gran afinidad por una de las formas
protonadas de la lumiflavina.
En concordancia con los resultados de otros estudios acerca de la actividad IMAO-A
y -B de B-carbolinas, éstas resultaron ser potentes inhibidoras de la MAO-A, e inhibidoras muy
pobres de la MAO-B. La actividad IMAO-A de las B-carbolinas se correlaciona con la
formación de complejos de transferencia de carga entre flavinas y B-carbolinas. La
formación de complejos de transferencia de carga se correlaciona a su vez con el potencial
químico electrónico, la electrofilia, la carga crítica y la transferencia de carga, mientras que
la actividad IMAO-A muestra una fuerte dependencia del potencial químico electrónico, de
la electrofilia y de la transferencia de carga.
La inhibición del crecimiento de cultivos de epimastigotes de Trypanosoma cruzi en la
cepa LQ depende de la lipofilia de las B-carbolinas y de la unión de éstas a flavinas
(riboflavina, FAD). La inhibición del consumo de oxígeno en esta misma cepa también
dependería de la asociación B-carbolina-flavinas; además dependería del potencial
químico electrónico, de la electrofilia, de la carga criítica y de la transferencia de carga. En
la cepa Tulahuén tanto la inhibición del crecimiento de los cultivos como la inhibición del
consumo de oxígeno de los epimastigotes dependen de la lipofilia, de la asociación
B-carbolina-flavinas, de la electrofilia y de la carga crítica. Respecto al estudio electroquímico por VCL de las B-carbolinas, a pH fisiológico la
oxidación de algunos de estos compuestos sería compatible con los procesos redox de
sistemas biológicos, mientras que la reducción de ellas sería incompatible con dichos
sistemas. De manera general, la actividad antioxidante de las B-carbolinas se relaciona con los potenciales de oxidación de estos compuestos. A pH 7 ia reducción de estos alcaloides se
correlaciona con la electrofilia y la carga crítica, mientras que la oxidación se correlaciona
con el potencial químico electrónico. En medio aprótico (DMSO) la reducción de las
B-carbolinas se correlaciona con el potencial químico electrónico, con la electrofilia y la
carga crítica.
Por último, la 1,2,3,4-tetrahidro-B-carbolina se oxida electroquímicamente en medio
aprótico generando un radical libre de vida muy corta, detectable por EPR en presencia de
un atrapador de radicales libres. The B-carboline moiety, 9-H-pyrido[3,4-b]indole, is the basic scaffold of a group of
indole alkaloids which have a variety of biological activities. The mechanisms of action of Bcarbolines in the central nervous system or as anticancer agents are increasingly well known
nowadays. Nevertheless, with regard to their chemotherapeutic properties or their enzymatic
activities, the scientific literature only reports screening results, leaving these mechanisms less
understood.
This thesis presents a physico-chemical study of these alkaloids, centered on two
areas: one, in which the electronic properties and some chemical reactivity descriptors,
defined in the context of the conceptual part of Density Functional Theory, are calculated for
the f-carbolines at the B3LYP/6-31G level of theory; and the other, an electrochemical study
based on cyclic voltametry, in aqueous media at different pH values, and in an aprotic
solvent (DMSO). Also, this thesis presents for the first time the detection - using electron
paramagnetic resonance (EPR) in the presence of a spin trapper- of a tree radical species
which is the product of the electrochemical oxidation of tetrahydro-B-carboline in an aprotic
solvent.
The scientific literature reports that &-carbolines form complex associations with flavins
(FAD, riboflavin) through a charge-transfer process. This fact led us to a theoretical study of
the hydride transfer reaction between lumiflavine (7.8,10-trimethylisoalloxazine) and 1-
methylnicotinamide, using their electronic properties and their chemical reactivity descriptors,
as a simplified model of the FAD-NAD(P)H system which participates in the catalytic processes
of a considerable number of enzymes, and with which B-carbolines could interfere through a
FAD-B-carboline interaction.
Considering the results obtained, the relationship between physical-chemical
characteristics and biological activity was evaluated for several B-carbolines. The MAOI-A
and MAOI-B activities of some &-carbolines was determined. The trypanosomicidal activity
towards epimastigotes of Trypanosoma cruzi belonging to two the Tulahuén and LQ strains,
which have different susceptibilities towards nifurtimox, a drug used clinically in the treatment
of Chagas' disease, was also evaluated.
With regard to the hydride transfer reaction in the isoalloxazine-nicotinamide system, it
can be understood as an interaction between soft species, controlled by frontier orbitals and
nicely framed within the HSAB principle. The reactivity of the studied systems is well described
by overall molecular descriptors derived from the conceptual part of DFT, such as the
electronic chemical potential, electrophilicity and softness. Regiospecificity of the hydride
transfer reaction in the isoailoxazine-nicotinamide system seems to be consistently modulated
by properties of extended molecular regions, including more than one atomic centre. In this
work it was found that reactive sites in interacting molecules are located in regions of the
different molecular frameworks, with similar shapes and sizes, which display very similar group
softnesses.
With regard to the electronic structure and the chemical reactivity descriptors of Bcarbolines it was found that, in the pyridoindole moiety, the chemical hardness and the
chemical softness depend on the aromaticity of the system, whilst the electronic chemical
potential is dependent on the degree of insaturation for these compounds. The
electrophilicity and the critical charge display a less clear trend, due to their dependence on
both the electronic chemical potential and the chemical hardness: dihydro-B-carbolines are
the most electrophilic analogues and they display the highest values for the critical charge,
whilst tetrahydro-B-carbolines are the least electrophilic, and they display the lowest values of the critical charge. Analysis of the reactivity descriptors in the lumiflavine-B-carboline system
suggests that these alkaloids donate charge to the lumiflavine molecule; besides, B-carbolines
should have high affinity for one of the protonated forms of lumiflavine.
Concerning the MAOI-A and -B activities of B-carbolines, the results obtained in this
work are in agreement with those obtained by other authors: B-carbolines are potent inhibitors
of MAO-A and very poor inhibitors of MAO-B. It was also found in this work that the MAOI-A
activity is related to the formation of charge transfer complexes between flavins and &
carbolines. In tum, the formation of charge transfer complexes is correlated with the
electronic chemical potential, electrophilicity, critical charge and charge transfer. MAOI-A
activity shows a strong dependence on the electronic chemical potential, electrophilicity and
charge transfer.
Inhibition of growth of Trypanosoma cruzi epimastigote cultures of the LQ strain
depends on the f-carbolines' lipophilicity and on the B-carboline-flavin association (riboflavin,
FAD). The inhibition of oxygen uptake in this strain also seems to depend on the &-carbolineflavin association, on the electronic chemical potential, electrophilicity, critical charge and
charge transfer. In the Tulahuén strain both the inhibition of culture growih and of oxygen
uptake by the epimastigotes depends on lipophilicity, B-carboline-flavin association,
electrophilicity and critical charge.
Regarding the linear cyclic voltammetric electrochemical study of B-carbolines at
physiological pH, the oxidation of some of these compounds would be compatible with redox
processes of biological systems; while the reduction of the same would not be possible with
them. In general terms, the antioxidant activity of B-carbolines is related to the oxidation
potentials of these compounds. Finally, 1,2,3,4-tetrahydro-B-carboline is oxidised electrochemically in aprotic solution
generating a free radical species with a very short half-life, making it only detectable by EPR
in the presence of a spin trapper.
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Doctor en Quimica
Patrocinador
Comision Nacional de Investigacion en Ciencias y Tecnologia (CONICYT), beca para alumnos de Doctorado Fondo Nacional de Ciencias Tegnologicas (FODECYT),proyecto N° 2950013 Beca PG-95 del departamento de posgrado y postitulo de la Universidad de Chile j
Identifier
URI: https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/189988
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