Efectos de la rizosfera de Colletia Hystrix sobre la comunidad bacteriana del suelo

Abstract

La rizósfera puede influir sobre la microbiota del suelo afectando diversos parámetros bióticos y abióticos de su entorno, produciendo cambios en la estructura (composición y abundancia) de la comunidad bacteriana total que la distinguen de la microbiota del suelo sin cobertura vegetal. Para este estudio se recolectaron un total de nueve muestras de suelo correspondientes a la rizósfera actinorrícica (Colletia hystrix), de plantas noactinorrícicas, y suelo sin cobertura vegetal durante los meses de Mayo y Octubre del 2004 en la localidad de "El Romeral", Cajón del Maipo. Para determinar la diversidad y estructura de biotipos presentes en la comunidad bacteriana se utilizó el método del TRFLP (polimorfismo en la longitud de los fragmentos terminales de restricción) utilizando como marcador molecular el gen 16S rDNA. El análisis de los electroferogramas obtenidos mediante T-RFLP revela diferencias en la estructura de la comunidad bacteriana asociada a la rizósfera comparada con aquella presente en suelo sin cobertura vegetal. El dendrograma y el análisis por correspondencia muestran una tendencia de agrupamiento según el origen de las muestras, observándose tres grupos distintos que corresponden a: rizósfera de plantas actinorrícicas (Colletia hystrix), plantas no actinorrícicas y suelo sin cobertura vegetal. Las muestras con mayor diversidad corresponden a suelo sin cobertura vegetal y existe una predominancia de Proteobacterias en todas las muestras. El método del T-RFLP resultó ser confiable y reproducible para este tipo de análisis. La estructura de las comunidades microbianas en la rizósfera depende del tipo de cobertura vegetal asociada, sin embargo es más compleja en suelo sin cobertura vegetal.

The rhizosphere can influence the soil microbiota by exerting an effect on various biotic and abiotic parameters of its surroundings, producing changes in the structure (composition and abundance) of the total bacterial community and distinguishing it from the microbiota in soil without plant cover. For this study, a total of nine soil samples corresponding to the rhizosphere were collected, actinorhizal (Colletia hystrix), non-actinorhizal plants, and soil without plant cover, during the months of May and October of 2004 in the locality of "El Romeral" Cajón del Maipo. In order to determine the diversity and structure of biotypes present in the bacterial community, the T-RFLP method was used (terminal restriction fragment length polymorphism) using the 16S rDNA as a molecular gene marker. The T-RFLP electropherogram analysis reveals differences in the structure of the associated bacterial community to the rhizosphere compared with that present in soil without plant cover. The dendrograms and the correspondence analyses show that the samples cluster according to their origin. Three different clusters are observed that correspond to: rhizosphere from actinorhizal plants (Colletia hystrix), non-actinorhizal plants and soil without plant cover. In addition, the Proteobacterias predominate in the different samples. The samples with a greater diversity correspond to soil without plant cover. The T-RFLP method was useful and reproducible for this type of analysis. The structure of the microbial communities in the rhizosphere depends on the type of plant cover associated; nevertheless it is more complex in soil without plant cover.