Un rol para la dinámica molecular en el modelado de macromoléculas biológicas

Abstract

La bioinformatica, sincretismo científico-técnico entre la biología y las tecnologías de la información, cobra cada vez mas relevancia dentro las ciencias biológicas debido al gran aumento en la capacidad tecnológica para la obtención de datos empíricos. Dentro de los tópicos que estudia la bioinformatica se encuentra la generación de modelos tridimensionales para la estructura de proteínas que no han sido determinadas experimentalmente. En este ámbito, uno de los métodos mas populares para la realización de esta tarea dice relación con el modelado comparativo por satisfacción de restricciones espaciales, implementado en el programa MODELLER. Las estructuras tridimensionales derivadas de este proceso deben ser evaluadas, objetivo para el cual existen diversas herramientas que funcionan de manera adecuada cuando se trabaja en el ámbito de la alta identidad de secuencia, fallando consistentemente para modelos obtenidos a baja identidad de secuencia.