Estudio predictivo de sobrevida en base a una propuesta de genes en pacientes con Glioblastoma

Abstract

La presente tesis pretende estudiar un conjunto de genes de interés debido a la particular coincidencia de dichos genes en estudios experimentales previos realizados en células madre de glioblastoma en ratones, células madre de glioblastoma aisladas de muestras humanas de gliobastoma y nanotubos (tunneling nanotubes, TNT) aislados por microdisección por captura de láser (laser capture microdisection) de macrófagos infectados con VIH. Dichos genes son de interés científico debido al rol común que estos cumplen en vías metabólicas y que en este trabajo se postulan como una vía característica para el desarrollo y propagación de dichas enfermedades, cáncer y VIH. Para su abordaje inicial, se realizó un análisis de sobrevida de dichos genes utilizando datos públicos de transcriptómica de muestras de glioblastoma con datos de acceso público. Conociendo las limitaciones de realizar dichos análisis en ensayos que priorizan la señal de genes sobre-regulados en el macerado del tumor, se pudo comprobar la escasa representación que tienen los genes seleccionados debido a la baja representación de su señal en el tumor completo. Los genes seleccionados mostraron tener una estructura de agrupación mixta en cuanto a sus funciones biológicas, es decir, no se descarta la participación conjunta de dichos genes en múltiples mecanismos de resistencia al tratamiento a nivel de esta reducida, pero importante subpoblación celular. Su poder predictivo fue muy bajo, lo cual descarta mayor relevancia de estos en la sobrevida del paciente a nivel de información genética de larga-escala. Sin embargo, se espera poder entregar un contexto biológico 6 adicional en estudios posteriores, que crucen la información de estos pacientes a nivel de las subpoblaciones celulares de interés y no del tumor completo.