Caracterización de la microbiota fúngica asociada a flores y bayas de uva de mesa cultivar Thompson Seedless

Abstract

El sostenido aumento en el tiempo de las cepas de Botrytis cinerea resistentes a fungicidas de interés comercial ha suscitado el interés en buscar alternativas de manejo como los agentes de control biológico (ACB). En este estudio se obtuvieron aislados monospóricos a partir de flores y bayas sanas de uva de mesa cv. Thompson Seedless de dos regiones de Chile (Metropolitana y O’Higgins), los que fueron identificados mediante filogenia molecular. Se identificaron 50 especies, sin considerar a B. cinerea, la mayoría de éstas han sido catalogadas como patógenos de vides u otros cultivos como Alternaria, Penicillium, Aspergillus y Rhizopus. Por otro lado, se identificaron especies de hongos no reportadas en Chile y/o en uva de mesa. Se seleccionaron aquellos no patogénicos y se sometieron a pruebas de crecimiento dual in vitro contra dos cepas de B. cinerea resistentes a boscalid y fenhexamid; adicionalmente, se evaluó la capacidad de sobrevivencia de los candidatos bajo concentraciones crecientes de boscalid y fenhexamid. Se observo una diferencia estadísticamente significativa entre la capacidad de biocontrol de los ACB frente a B. cinereas, las cepas resistentes eran menos inhibidas por los ACB que una cepa sensible, lo que indicaría que el problema de la resistencia sería aún más complicado de manejar. El género Trichoderma presento una gran cantidad de aislados de múltiples especies y fue el que mejor desempeño tuvo en las pruebas de biocontrol, tres aislados obtuvieron un porcentaje de inhibición del crecimiento radial >50% y uno de ellos no se vio afectado por ambos fungicidas a ninguna concentración, por lo que se perfila como una opción de ACB aclimatado a vides en Chile y compatible con las aplicaciones de fungicidas.

The sustained increase over time of resistant strains of Botrytis cinerea resistant to commercially available fungicides has raised interest in non-synthetic alternatives products such as plant extracts and biological control agents (BCAs). In this study, monosporic isolates of filamentous fungi were obtained from healthy berries and flowers of table grape cv. Thompson Seedless from two regions in Chile (Metropolitana and O’Higgins), which were identified by molecular phylogeny. From the fungal microbiota, fifty species were identified, excluding B. cinerea isolates, most of these species are catalogued as pathogens for grapevine and other plant species, like Alternaria, Penicillium, Rhizopus and Aspergillus. Additionally, non-reported fungal species for Chile and/or grapevines were isolated. Those that were not pathogenic were selected for in vitro dual growth tests against two strains of B. cinerea resistant to boscalid and fenhexamid, in addition, the survival capacity of the candidates was evaluated under increasing concentrations of boscalid and fenhexamid. Dual culture test shown a statistically significant difference between the biocontrol capacity of CBAs against B. cinerea resistant strains and sensitive strain, which would indicate that the problem of resistance would be even more difficult to manage. The Trichoderma genus presented numerous isolates of multiple species and the best performance in the biocontrol tests, three isolates obtained a percentage of inhibition of the radial growth >50% and one of them was not affected by both fungicides at all concentrations, so it emerges as an acclimatized to grapevines in Chile CBA option, compatible with fungicide applications.