Interacción entre variantes del gen mtr y la metilación global del adn en el riesgo de fisura de labio con o sin fisura de paladar no sindrómica (fl/pns) en Chile

Abstract

Introducción: Se ha reportado una relación tanto entre los niveles de metilación de ADN como entre variantes de genes del metabolismo mono-carbonado y la fisura labiopalatina no sindrómica (FL/PNS). Es por ello por lo que este trabajo de tesis propone evaluar la presencia de interacción entre cuatro polimorfismos (SNPs) del gen MTR, previamente asociados a FLPN/S, y la metilación global del ADN en el riesgo de esta malformación en la población chilena. Metodología: Se analizaron muestras de ADN de 83 casos y 84 controles de población chilena con FL/PNS pareadas en sexo y edad de los sujetos de los cuales se extrajeron los genotipos de las variantes del gen MTR: rs1805087, rs10925239, rs10925254 y rs3768142. De estas muestras también se obtuvieron los porcentajes metilación global del ADN (metilación de LINE-1) de un estudio previo. Mediante una prueba de ANOVA de dos vías se analizó la posible diferencia en los promedios de metilación del ADN entre los genotipos de los cuatro SNPs comparando casos y controles. El mismo análisis se llevó a cabo considerando haplotipos construidos con las combinatorias de estas variantes. El segundo análisis consistió en determinar la existencia de un posible efecto mediador de la metilación global del ADN en la relación entre haplotipos y la expresión del fenotipo. Resultados: No existe una distribución diferencial de la metilación global del ADN de acuerdo con los genotipos de ninguno de los SNPs en estudio del gen MTR, tanto para la muestra total como separada por sexo de los sujetos. Sólo se detectó una relación entre haplotipos de todas las variantes y la metilación del ADN en casos, pero no en controles. Con esto se llevó a cabo el análisis de mediación, en que la combinatoria de los cuatro SNPs no presenta un efecto mediador entre las variables en estudio. Conclusiones: Nuestros resultados no significativos impulsan a realizar investigaciones con tamaños muestrales mayores, así como incluir análisis de metilación de promotores o islas CpG de genes específicos por sobre la metilación global.